Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Fyco1Q8VDC1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Fyco1Q8VDC1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Fyco1Q8VDC1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Fyco1Q8VDC1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Fyco1Q8VDC1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Fyco1Q8VDC1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Fyco1Q8VDC1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Fyco1Q8VDC1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Fyco1Q8VDC1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Fyco1Q8VDC1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Fyco1Q8VDC1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Fyco1Q8VDC1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Fyco1Q8VDC1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Fyco1Q8VDC1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Fyco1Q8VDC1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Fyco1Q8VDC1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Fyco1Q8VDC1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Fyco1Q8VDC1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Fyco1Q8VDC1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
Fyco1Q8VDC1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Fyco1Q8VDC1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Fyco1Q8VDC1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Fyco1Q8VDC1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
Fyco1Q8VDC1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Fyco1Q8VDC1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Fyco1Q8VDC1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Fyco1Q8VDC1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Fyco1Q8VDC1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Fyco1Q8VDC1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Fyco1Q8VDC1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Fyco1Q8VDC1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Fyco1Q8VDC1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Fyco1Q8VDC1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Fyco1Q8VDC1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Fyco1Q8VDC1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Fyco1Q8VDC1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Fyco1Q8VDC1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Fyco1Q8VDC1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Fyco1Q8VDC1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
Fyco1Q8VDC1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Fyco1Q8VDC1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Fyco1Q8VDC1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Fyco1Q8VDC1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
Fyco1Q8VDC1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Fyco1Q8VDC1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Fyco1Q8VDC1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Fyco1Q8VDC1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Fyco1Q8VDC1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Fyco1Q8VDC1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Fyco1Q8VDC1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
Fyco1Q8VDC1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
Fyco1Q8VDC1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
Fyco1Q8VDC1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Fyco1Q8VDC1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Fyco1Q8VDC1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Fyco1Q8VDC1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
Fyco1Q8VDC1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Fyco1Q8VDC1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Fyco1Q8VDC1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Fyco1Q8VDC1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Fyco1Q8VDC1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Fyco1Q8VDC1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Fyco1Q8VDC1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Fyco1Q8VDC1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Fyco1Q8VDC1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Fyco1Q8VDC1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Fyco1Q8VDC1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Fyco1Q8VDC1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Fyco1Q8VDC1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
Fyco1Q8VDC1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Fyco1Q8VDC1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Fyco1Q8VDC1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Fyco1Q8VDC1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
Fyco1Q8VDC1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Fyco1Q8VDC1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
Fyco1Q8VDC1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Fyco1Q8VDC1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Fyco1Q8VDC1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Fyco1Q8VDC1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Fyco1Q8VDC1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Fyco1Q8VDC1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Fyco1Q8VDC1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Fyco1Q8VDC1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Fyco1Q8VDC1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Fyco1Q8VDC1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Fyco1Q8VDC1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Fyco1Q8VDC1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Fyco1Q8VDC1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Fyco1Q8VDC1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Fyco1Q8VDC1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
Fyco1Q8VDC1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Fyco1Q8VDC1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Fyco1Q8VDC1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Fyco1Q8VDC1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Fyco1Q8VDC1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Fyco1Q8VDC1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Fyco1Q8VDC1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Fyco1Q8VDC1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
Fyco1Q8VDC1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms