Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Fam20bQ8VCS3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Fam20bQ8VCS3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Fam20bQ8VCS3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Fam20bQ8VCS3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Fam20bQ8VCS3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Fam20bQ8VCS3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Fam20bQ8VCS3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Fam20bQ8VCS3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Fam20bQ8VCS3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Fam20bQ8VCS3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Fam20bQ8VCS3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Fam20bQ8VCS3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Fam20bQ8VCS3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Fam20bQ8VCS3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Fam20bQ8VCS3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Fam20bQ8VCS3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Fam20bQ8VCS3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Fam20bQ8VCS3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Fam20bQ8VCS3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Fam20bQ8VCS3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fam20bQ8VCS3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fam20bQ8VCS3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fam20bQ8VCS3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fam20bQ8VCS3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam20bQ8VCS3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam20bQ8VCS3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam20bQ8VCS3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam20bQ8VCS3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam20bQ8VCS3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam20bQ8VCS3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam20bQ8VCS3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam20bQ8VCS3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam20bQ8VCS3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam20bQ8VCS3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam20bQ8VCS3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam20bQ8VCS3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Fam20bQ8VCS3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Fam20bQ8VCS3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fam20bQ8VCS3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Fam20bQ8VCS3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam20bQ8VCS3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam20bQ8VCS3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam20bQ8VCS3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam20bQ8VCS3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fam20bQ8VCS3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fam20bQ8VCS3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam20bQ8VCS3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam20bQ8VCS3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam20bQ8VCS3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam20bQ8VCS3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam20bQ8VCS3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam20bQ8VCS3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam20bQ8VCS3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam20bQ8VCS3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam20bQ8VCS3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam20bQ8VCS3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam20bQ8VCS3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam20bQ8VCS3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam20bQ8VCS3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam20bQ8VCS3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam20bQ8VCS3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam20bQ8VCS3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam20bQ8VCS3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam20bQ8VCS3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam20bQ8VCS3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam20bQ8VCS3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam20bQ8VCS3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam20bQ8VCS3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fam20bQ8VCS3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fam20bQ8VCS3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fam20bQ8VCS3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Fam20bQ8VCS3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam20bQ8VCS3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam20bQ8VCS3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam20bQ8VCS3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam20bQ8VCS3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam20bQ8VCS3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam20bQ8VCS3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam20bQ8VCS3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam20bQ8VCS3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam20bQ8VCS3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam20bQ8VCS3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam20bQ8VCS3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam20bQ8VCS3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam20bQ8VCS3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam20bQ8VCS3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam20bQ8VCS3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam20bQ8VCS3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam20bQ8VCS3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam20bQ8VCS3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam20bQ8VCS3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam20bQ8VCS3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam20bQ8VCS3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam20bQ8VCS3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam20bQ8VCS3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam20bQ8VCS3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam20bQ8VCS3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fam20bQ8VCS3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fam20bQ8VCS3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
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