Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC19

Alas1, 5-aminolevulinate synthase, nonspecific, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alas1Q8VC19 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Alas1Q8VC19 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Alas1Q8VC19 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Alas1Q8VC19 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Alas1Q8VC19 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Alas1Q8VC19 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Alas1Q8VC19 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Alas1Q8VC19 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Alas1Q8VC19 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Alas1Q8VC19 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Alas1Q8VC19 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Alas1Q8VC19 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Alas1Q8VC19 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Alas1Q8VC19 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Alas1Q8VC19 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Alas1Q8VC19 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Alas1Q8VC19 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Alas1Q8VC19 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Alas1Q8VC19 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Alas1Q8VC19 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Alas1Q8VC19 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Alas1Q8VC19 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Alas1Q8VC19 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Alas1Q8VC19 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Alas1Q8VC19 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Alas1Q8VC19 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Alas1Q8VC19 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Alas1Q8VC19 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Alas1Q8VC19 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Alas1Q8VC19 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Alas1Q8VC19 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Alas1Q8VC19 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Alas1Q8VC19 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Alas1Q8VC19 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Alas1Q8VC19 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Alas1Q8VC19 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Alas1Q8VC19 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Alas1Q8VC19 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Alas1Q8VC19 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Alas1Q8VC19 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Alas1Q8VC19 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Alas1Q8VC19 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Alas1Q8VC19 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Alas1Q8VC19 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Alas1Q8VC19 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Alas1Q8VC19 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Alas1Q8VC19 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Alas1Q8VC19 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Alas1Q8VC19 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Alas1Q8VC19 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Alas1Q8VC19 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Alas1Q8VC19 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Alas1Q8VC19 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Alas1Q8VC19 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Alas1Q8VC19 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Alas1Q8VC19 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Alas1Q8VC19 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Alas1Q8VC19 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Alas1Q8VC19 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Alas1Q8VC19 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Alas1Q8VC19 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Alas1Q8VC19 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Alas1Q8VC19 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Alas1Q8VC19 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Alas1Q8VC19 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Alas1Q8VC19 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Alas1Q8VC19 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Alas1Q8VC19 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Alas1Q8VC19 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Alas1Q8VC19 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Alas1Q8VC19 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Alas1Q8VC19 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Alas1Q8VC19 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Alas1Q8VC19 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Alas1Q8VC19 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Alas1Q8VC19 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Alas1Q8VC19 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Alas1Q8VC19 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Alas1Q8VC19 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Alas1Q8VC19 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Alas1Q8VC19 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Alas1Q8VC19 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Alas1Q8VC19 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Alas1Q8VC19 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Alas1Q8VC19 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Alas1Q8VC19 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Alas1Q8VC19 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Alas1Q8VC19 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Alas1Q8VC19 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Alas1Q8VC19 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Alas1Q8VC19 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Alas1Q8VC19 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Alas1Q8VC19 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Alas1Q8VC19 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Alas1Q8VC19 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Alas1Q8VC19 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Alas1Q8VC19 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Alas1Q8VC19 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Alas1Q8VC19 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Alas1Q8VC19 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms