Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4B8

Nlrp3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,033 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp3Q8R4B8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nlrp3Q8R4B8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nlrp3Q8R4B8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nlrp3Q8R4B8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nlrp3Q8R4B8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nlrp3Q8R4B8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nlrp3Q8R4B8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nlrp3Q8R4B8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nlrp3Q8R4B8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nlrp3Q8R4B8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nlrp3Q8R4B8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nlrp3Q8R4B8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nlrp3Q8R4B8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nlrp3Q8R4B8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nlrp3Q8R4B8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nlrp3Q8R4B8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nlrp3Q8R4B8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nlrp3Q8R4B8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Nlrp3Q8R4B8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nlrp3Q8R4B8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nlrp3Q8R4B8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nlrp3Q8R4B8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Nlrp3Q8R4B8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nlrp3Q8R4B8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nlrp3Q8R4B8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nlrp3Q8R4B8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nlrp3Q8R4B8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nlrp3Q8R4B8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nlrp3Q8R4B8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Nlrp3Q8R4B8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nlrp3Q8R4B8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nlrp3Q8R4B8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nlrp3Q8R4B8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nlrp3Q8R4B8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nlrp3Q8R4B8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nlrp3Q8R4B8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nlrp3Q8R4B8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nlrp3Q8R4B8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nlrp3Q8R4B8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nlrp3Q8R4B8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nlrp3Q8R4B8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nlrp3Q8R4B8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Nlrp3Q8R4B8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Nlrp3Q8R4B8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nlrp3Q8R4B8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nlrp3Q8R4B8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nlrp3Q8R4B8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nlrp3Q8R4B8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nlrp3Q8R4B8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nlrp3Q8R4B8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nlrp3Q8R4B8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nlrp3Q8R4B8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nlrp3Q8R4B8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nlrp3Q8R4B8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nlrp3Q8R4B8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nlrp3Q8R4B8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nlrp3Q8R4B8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nlrp3Q8R4B8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nlrp3Q8R4B8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nlrp3Q8R4B8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nlrp3Q8R4B8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nlrp3Q8R4B8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nlrp3Q8R4B8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Nlrp3Q8R4B8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nlrp3Q8R4B8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nlrp3Q8R4B8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nlrp3Q8R4B8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nlrp3Q8R4B8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nlrp3Q8R4B8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nlrp3Q8R4B8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nlrp3Q8R4B8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nlrp3Q8R4B8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nlrp3Q8R4B8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nlrp3Q8R4B8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nlrp3Q8R4B8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nlrp3Q8R4B8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nlrp3Q8R4B8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nlrp3Q8R4B8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nlrp3Q8R4B8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nlrp3Q8R4B8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nlrp3Q8R4B8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nlrp3Q8R4B8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nlrp3Q8R4B8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Nlrp3Q8R4B8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Nlrp3Q8R4B8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nlrp3Q8R4B8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nlrp3Q8R4B8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nlrp3Q8R4B8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nlrp3Q8R4B8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Nlrp3Q8R4B8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nlrp3Q8R4B8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nlrp3Q8R4B8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nlrp3Q8R4B8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nlrp3Q8R4B8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nlrp3Q8R4B8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nlrp3Q8R4B8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nlrp3Q8R4B8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nlrp3Q8R4B8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nlrp3Q8R4B8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nlrp3Q8R4B8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.6 ms