Protein–RNA interactions for Protein: Q8R332

Nup58, Nucleoporin p58/p45, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup58Q8R332 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nup58Q8R332 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nup58Q8R332 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nup58Q8R332 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nup58Q8R332 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nup58Q8R332 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nup58Q8R332 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nup58Q8R332 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nup58Q8R332 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nup58Q8R332 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nup58Q8R332 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nup58Q8R332 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nup58Q8R332 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nup58Q8R332 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nup58Q8R332 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nup58Q8R332 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nup58Q8R332 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nup58Q8R332 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nup58Q8R332 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nup58Q8R332 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nup58Q8R332 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nup58Q8R332 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nup58Q8R332 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nup58Q8R332 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nup58Q8R332 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nup58Q8R332 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nup58Q8R332 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nup58Q8R332 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nup58Q8R332 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nup58Q8R332 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nup58Q8R332 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nup58Q8R332 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nup58Q8R332 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nup58Q8R332 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nup58Q8R332 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nup58Q8R332 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nup58Q8R332 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nup58Q8R332 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nup58Q8R332 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nup58Q8R332 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nup58Q8R332 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nup58Q8R332 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nup58Q8R332 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nup58Q8R332 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nup58Q8R332 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nup58Q8R332 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nup58Q8R332 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nup58Q8R332 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nup58Q8R332 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nup58Q8R332 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nup58Q8R332 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nup58Q8R332 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nup58Q8R332 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nup58Q8R332 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nup58Q8R332 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nup58Q8R332 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nup58Q8R332 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nup58Q8R332 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nup58Q8R332 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nup58Q8R332 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nup58Q8R332 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nup58Q8R332 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nup58Q8R332 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nup58Q8R332 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nup58Q8R332 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nup58Q8R332 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nup58Q8R332 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nup58Q8R332 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nup58Q8R332 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nup58Q8R332 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nup58Q8R332 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nup58Q8R332 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nup58Q8R332 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nup58Q8R332 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nup58Q8R332 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nup58Q8R332 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nup58Q8R332 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nup58Q8R332 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nup58Q8R332 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nup58Q8R332 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nup58Q8R332 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Nup58Q8R332 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nup58Q8R332 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nup58Q8R332 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nup58Q8R332 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nup58Q8R332 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nup58Q8R332 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nup58Q8R332 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nup58Q8R332 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nup58Q8R332 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nup58Q8R332 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nup58Q8R332 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nup58Q8R332 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nup58Q8R332 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nup58Q8R332 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nup58Q8R332 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nup58Q8R332 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nup58Q8R332 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nup58Q8R332 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nup58Q8R332 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms