Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0F3

Sumf1, Sulfatase-modifying factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumf1Q8R0F3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sumf1Q8R0F3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Sumf1Q8R0F3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sumf1Q8R0F3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Sumf1Q8R0F3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Sumf1Q8R0F3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sumf1Q8R0F3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sumf1Q8R0F3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sumf1Q8R0F3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sumf1Q8R0F3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sumf1Q8R0F3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sumf1Q8R0F3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sumf1Q8R0F3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sumf1Q8R0F3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sumf1Q8R0F3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sumf1Q8R0F3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sumf1Q8R0F3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sumf1Q8R0F3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sumf1Q8R0F3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Sumf1Q8R0F3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Sumf1Q8R0F3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Sumf1Q8R0F3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sumf1Q8R0F3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sumf1Q8R0F3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sumf1Q8R0F3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sumf1Q8R0F3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sumf1Q8R0F3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sumf1Q8R0F3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sumf1Q8R0F3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sumf1Q8R0F3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sumf1Q8R0F3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sumf1Q8R0F3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sumf1Q8R0F3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sumf1Q8R0F3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sumf1Q8R0F3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sumf1Q8R0F3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Sumf1Q8R0F3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sumf1Q8R0F3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sumf1Q8R0F3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sumf1Q8R0F3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sumf1Q8R0F3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sumf1Q8R0F3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sumf1Q8R0F3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sumf1Q8R0F3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sumf1Q8R0F3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sumf1Q8R0F3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sumf1Q8R0F3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sumf1Q8R0F3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sumf1Q8R0F3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sumf1Q8R0F3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Sumf1Q8R0F3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sumf1Q8R0F3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sumf1Q8R0F3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sumf1Q8R0F3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sumf1Q8R0F3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sumf1Q8R0F3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sumf1Q8R0F3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sumf1Q8R0F3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sumf1Q8R0F3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Sumf1Q8R0F3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sumf1Q8R0F3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sumf1Q8R0F3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sumf1Q8R0F3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sumf1Q8R0F3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sumf1Q8R0F3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sumf1Q8R0F3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sumf1Q8R0F3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sumf1Q8R0F3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sumf1Q8R0F3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sumf1Q8R0F3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sumf1Q8R0F3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sumf1Q8R0F3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sumf1Q8R0F3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sumf1Q8R0F3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sumf1Q8R0F3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sumf1Q8R0F3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sumf1Q8R0F3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sumf1Q8R0F3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Sumf1Q8R0F3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sumf1Q8R0F3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sumf1Q8R0F3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sumf1Q8R0F3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Sumf1Q8R0F3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sumf1Q8R0F3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sumf1Q8R0F3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Sumf1Q8R0F3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sumf1Q8R0F3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sumf1Q8R0F3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Sumf1Q8R0F3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sumf1Q8R0F3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sumf1Q8R0F3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sumf1Q8R0F3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sumf1Q8R0F3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sumf1Q8R0F3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sumf1Q8R0F3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sumf1Q8R0F3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sumf1Q8R0F3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Sumf1Q8R0F3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Sumf1Q8R0F3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sumf1Q8R0F3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms