Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q0

Rptor, Regulatory-associated protein of mTOR, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RptorQ8K4Q0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RptorQ8K4Q0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RptorQ8K4Q0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RptorQ8K4Q0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RptorQ8K4Q0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RptorQ8K4Q0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RptorQ8K4Q0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RptorQ8K4Q0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
RptorQ8K4Q0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RptorQ8K4Q0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RptorQ8K4Q0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RptorQ8K4Q0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RptorQ8K4Q0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RptorQ8K4Q0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RptorQ8K4Q0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RptorQ8K4Q0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RptorQ8K4Q0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RptorQ8K4Q0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RptorQ8K4Q0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RptorQ8K4Q0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RptorQ8K4Q0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RptorQ8K4Q0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RptorQ8K4Q0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RptorQ8K4Q0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RptorQ8K4Q0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RptorQ8K4Q0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RptorQ8K4Q0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RptorQ8K4Q0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RptorQ8K4Q0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RptorQ8K4Q0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RptorQ8K4Q0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RptorQ8K4Q0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RptorQ8K4Q0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RptorQ8K4Q0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RptorQ8K4Q0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RptorQ8K4Q0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RptorQ8K4Q0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RptorQ8K4Q0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RptorQ8K4Q0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RptorQ8K4Q0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RptorQ8K4Q0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RptorQ8K4Q0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RptorQ8K4Q0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RptorQ8K4Q0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RptorQ8K4Q0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RptorQ8K4Q0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RptorQ8K4Q0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RptorQ8K4Q0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RptorQ8K4Q0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RptorQ8K4Q0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RptorQ8K4Q0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RptorQ8K4Q0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RptorQ8K4Q0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RptorQ8K4Q0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RptorQ8K4Q0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RptorQ8K4Q0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RptorQ8K4Q0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RptorQ8K4Q0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RptorQ8K4Q0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RptorQ8K4Q0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RptorQ8K4Q0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RptorQ8K4Q0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RptorQ8K4Q0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RptorQ8K4Q0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RptorQ8K4Q0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RptorQ8K4Q0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RptorQ8K4Q0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RptorQ8K4Q0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RptorQ8K4Q0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RptorQ8K4Q0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RptorQ8K4Q0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RptorQ8K4Q0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RptorQ8K4Q0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RptorQ8K4Q0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RptorQ8K4Q0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RptorQ8K4Q0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RptorQ8K4Q0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RptorQ8K4Q0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RptorQ8K4Q0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RptorQ8K4Q0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RptorQ8K4Q0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RptorQ8K4Q0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RptorQ8K4Q0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RptorQ8K4Q0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RptorQ8K4Q0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RptorQ8K4Q0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RptorQ8K4Q0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RptorQ8K4Q0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RptorQ8K4Q0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RptorQ8K4Q0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RptorQ8K4Q0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RptorQ8K4Q0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RptorQ8K4Q0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RptorQ8K4Q0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RptorQ8K4Q0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RptorQ8K4Q0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RptorQ8K4Q0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RptorQ8K4Q0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RptorQ8K4Q0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RptorQ8K4Q0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms