Protein–RNA interactions for Protein: Q8K424

Trpv3, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 3, mousemouse

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv3Q8K424 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trpv3Q8K424 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trpv3Q8K424 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trpv3Q8K424 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trpv3Q8K424 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trpv3Q8K424 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trpv3Q8K424 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trpv3Q8K424 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trpv3Q8K424 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trpv3Q8K424 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trpv3Q8K424 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trpv3Q8K424 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trpv3Q8K424 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trpv3Q8K424 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trpv3Q8K424 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Trpv3Q8K424 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trpv3Q8K424 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Trpv3Q8K424 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trpv3Q8K424 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Trpv3Q8K424 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trpv3Q8K424 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpv3Q8K424 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpv3Q8K424 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpv3Q8K424 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpv3Q8K424 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpv3Q8K424 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpv3Q8K424 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpv3Q8K424 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpv3Q8K424 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpv3Q8K424 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpv3Q8K424 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpv3Q8K424 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Trpv3Q8K424 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Trpv3Q8K424 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trpv3Q8K424 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trpv3Q8K424 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trpv3Q8K424 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trpv3Q8K424 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trpv3Q8K424 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trpv3Q8K424 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trpv3Q8K424 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trpv3Q8K424 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trpv3Q8K424 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trpv3Q8K424 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Trpv3Q8K424 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trpv3Q8K424 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trpv3Q8K424 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trpv3Q8K424 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trpv3Q8K424 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trpv3Q8K424 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trpv3Q8K424 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trpv3Q8K424 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trpv3Q8K424 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trpv3Q8K424 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Trpv3Q8K424 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trpv3Q8K424 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trpv3Q8K424 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trpv3Q8K424 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trpv3Q8K424 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trpv3Q8K424 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trpv3Q8K424 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trpv3Q8K424 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trpv3Q8K424 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trpv3Q8K424 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trpv3Q8K424 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trpv3Q8K424 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trpv3Q8K424 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trpv3Q8K424 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trpv3Q8K424 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trpv3Q8K424 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trpv3Q8K424 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trpv3Q8K424 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trpv3Q8K424 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trpv3Q8K424 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trpv3Q8K424 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trpv3Q8K424 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trpv3Q8K424 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trpv3Q8K424 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trpv3Q8K424 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trpv3Q8K424 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trpv3Q8K424 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trpv3Q8K424 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trpv3Q8K424 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trpv3Q8K424 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trpv3Q8K424 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trpv3Q8K424 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trpv3Q8K424 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trpv3Q8K424 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trpv3Q8K424 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trpv3Q8K424 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpv3Q8K424 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpv3Q8K424 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpv3Q8K424 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpv3Q8K424 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpv3Q8K424 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpv3Q8K424 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpv3Q8K424 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpv3Q8K424 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpv3Q8K424 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpv3Q8K424 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms