Protein–RNA interactions for Protein: Q8K348

Acvr1c, Activin receptor type-1C, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acvr1cQ8K348 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Acvr1cQ8K348 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Acvr1cQ8K348 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Acvr1cQ8K348 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Acvr1cQ8K348 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Acvr1cQ8K348 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Acvr1cQ8K348 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Acvr1cQ8K348 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Acvr1cQ8K348 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Acvr1cQ8K348 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Acvr1cQ8K348 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Acvr1cQ8K348 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Acvr1cQ8K348 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Acvr1cQ8K348 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Acvr1cQ8K348 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Acvr1cQ8K348 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Acvr1cQ8K348 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Acvr1cQ8K348 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Acvr1cQ8K348 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Acvr1cQ8K348 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Acvr1cQ8K348 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Acvr1cQ8K348 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Acvr1cQ8K348 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Acvr1cQ8K348 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Acvr1cQ8K348 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Acvr1cQ8K348 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Acvr1cQ8K348 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Acvr1cQ8K348 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Acvr1cQ8K348 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Acvr1cQ8K348 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Acvr1cQ8K348 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Acvr1cQ8K348 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Acvr1cQ8K348 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Acvr1cQ8K348 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Acvr1cQ8K348 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Acvr1cQ8K348 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Acvr1cQ8K348 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Acvr1cQ8K348 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Acvr1cQ8K348 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Acvr1cQ8K348 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Acvr1cQ8K348 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Acvr1cQ8K348 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Acvr1cQ8K348 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Acvr1cQ8K348 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Acvr1cQ8K348 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Acvr1cQ8K348 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Acvr1cQ8K348 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Acvr1cQ8K348 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Acvr1cQ8K348 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Acvr1cQ8K348 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Acvr1cQ8K348 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Acvr1cQ8K348 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Acvr1cQ8K348 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Acvr1cQ8K348 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Acvr1cQ8K348 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Acvr1cQ8K348 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Acvr1cQ8K348 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Acvr1cQ8K348 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Acvr1cQ8K348 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Acvr1cQ8K348 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Acvr1cQ8K348 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Acvr1cQ8K348 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Acvr1cQ8K348 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Acvr1cQ8K348 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Acvr1cQ8K348 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Acvr1cQ8K348 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Acvr1cQ8K348 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Acvr1cQ8K348 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Acvr1cQ8K348 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Acvr1cQ8K348 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Acvr1cQ8K348 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Acvr1cQ8K348 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Acvr1cQ8K348 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Acvr1cQ8K348 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Acvr1cQ8K348 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Acvr1cQ8K348 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Acvr1cQ8K348 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Acvr1cQ8K348 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Acvr1cQ8K348 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Acvr1cQ8K348 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Acvr1cQ8K348 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Acvr1cQ8K348 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Acvr1cQ8K348 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Acvr1cQ8K348 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Acvr1cQ8K348 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Acvr1cQ8K348 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Acvr1cQ8K348 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Acvr1cQ8K348 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Acvr1cQ8K348 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Acvr1cQ8K348 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Acvr1cQ8K348 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Acvr1cQ8K348 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Acvr1cQ8K348 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Acvr1cQ8K348 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Acvr1cQ8K348 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Acvr1cQ8K348 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Acvr1cQ8K348 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Acvr1cQ8K348 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Acvr1cQ8K348 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Acvr1cQ8K348 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms