Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ncapd2Q8K2Z4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ncapd2Q8K2Z4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ncapd2Q8K2Z4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ncapd2Q8K2Z4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ncapd2Q8K2Z4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ncapd2Q8K2Z4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ncapd2Q8K2Z4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ncapd2Q8K2Z4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ncapd2Q8K2Z4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ncapd2Q8K2Z4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ncapd2Q8K2Z4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ncapd2Q8K2Z4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ncapd2Q8K2Z4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ncapd2Q8K2Z4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ncapd2Q8K2Z4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ncapd2Q8K2Z4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ncapd2Q8K2Z4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ncapd2Q8K2Z4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ncapd2Q8K2Z4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ncapd2Q8K2Z4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ncapd2Q8K2Z4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ncapd2Q8K2Z4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ncapd2Q8K2Z4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ncapd2Q8K2Z4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ncapd2Q8K2Z4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ncapd2Q8K2Z4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ncapd2Q8K2Z4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ncapd2Q8K2Z4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ncapd2Q8K2Z4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ncapd2Q8K2Z4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ncapd2Q8K2Z4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ncapd2Q8K2Z4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ncapd2Q8K2Z4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ncapd2Q8K2Z4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ncapd2Q8K2Z4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ncapd2Q8K2Z4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ncapd2Q8K2Z4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ncapd2Q8K2Z4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ncapd2Q8K2Z4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ncapd2Q8K2Z4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ncapd2Q8K2Z4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ncapd2Q8K2Z4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ncapd2Q8K2Z4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ncapd2Q8K2Z4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ncapd2Q8K2Z4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ncapd2Q8K2Z4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ncapd2Q8K2Z4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ncapd2Q8K2Z4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ncapd2Q8K2Z4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ncapd2Q8K2Z4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ncapd2Q8K2Z4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ncapd2Q8K2Z4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ncapd2Q8K2Z4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ncapd2Q8K2Z4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ncapd2Q8K2Z4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ncapd2Q8K2Z4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ncapd2Q8K2Z4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ncapd2Q8K2Z4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ncapd2Q8K2Z4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Ncapd2Q8K2Z4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Ncapd2Q8K2Z4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ncapd2Q8K2Z4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ncapd2Q8K2Z4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ncapd2Q8K2Z4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ncapd2Q8K2Z4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ncapd2Q8K2Z4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ncapd2Q8K2Z4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ncapd2Q8K2Z4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ncapd2Q8K2Z4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ncapd2Q8K2Z4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ncapd2Q8K2Z4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ncapd2Q8K2Z4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ncapd2Q8K2Z4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ncapd2Q8K2Z4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ncapd2Q8K2Z4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ncapd2Q8K2Z4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ncapd2Q8K2Z4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ncapd2Q8K2Z4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ncapd2Q8K2Z4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ncapd2Q8K2Z4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Ncapd2Q8K2Z4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ncapd2Q8K2Z4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Ncapd2Q8K2Z4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ncapd2Q8K2Z4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ncapd2Q8K2Z4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ncapd2Q8K2Z4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ncapd2Q8K2Z4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.37
Ncapd2Q8K2Z4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ncapd2Q8K2Z4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ncapd2Q8K2Z4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ncapd2Q8K2Z4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ncapd2Q8K2Z4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ncapd2Q8K2Z4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ncapd2Q8K2Z4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ncapd2Q8K2Z4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ncapd2Q8K2Z4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms