Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y7

Mrpl47, 39S ribosomal protein L47, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl47Q8K2Y7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mrpl47Q8K2Y7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mrpl47Q8K2Y7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mrpl47Q8K2Y7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mrpl47Q8K2Y7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mrpl47Q8K2Y7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mrpl47Q8K2Y7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mrpl47Q8K2Y7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mrpl47Q8K2Y7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mrpl47Q8K2Y7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mrpl47Q8K2Y7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mrpl47Q8K2Y7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mrpl47Q8K2Y7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mrpl47Q8K2Y7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mrpl47Q8K2Y7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mrpl47Q8K2Y7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mrpl47Q8K2Y7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mrpl47Q8K2Y7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mrpl47Q8K2Y7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mrpl47Q8K2Y7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mrpl47Q8K2Y7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Mrpl47Q8K2Y7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mrpl47Q8K2Y7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mrpl47Q8K2Y7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Mrpl47Q8K2Y7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Mrpl47Q8K2Y7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mrpl47Q8K2Y7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Mrpl47Q8K2Y7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mrpl47Q8K2Y7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mrpl47Q8K2Y7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Mrpl47Q8K2Y7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mrpl47Q8K2Y7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mrpl47Q8K2Y7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mrpl47Q8K2Y7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mrpl47Q8K2Y7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mrpl47Q8K2Y7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mrpl47Q8K2Y7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mrpl47Q8K2Y7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mrpl47Q8K2Y7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mrpl47Q8K2Y7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mrpl47Q8K2Y7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mrpl47Q8K2Y7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mrpl47Q8K2Y7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mrpl47Q8K2Y7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Mrpl47Q8K2Y7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mrpl47Q8K2Y7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mrpl47Q8K2Y7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mrpl47Q8K2Y7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mrpl47Q8K2Y7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mrpl47Q8K2Y7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mrpl47Q8K2Y7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mrpl47Q8K2Y7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mrpl47Q8K2Y7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mrpl47Q8K2Y7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mrpl47Q8K2Y7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mrpl47Q8K2Y7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mrpl47Q8K2Y7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mrpl47Q8K2Y7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mrpl47Q8K2Y7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mrpl47Q8K2Y7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Mrpl47Q8K2Y7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mrpl47Q8K2Y7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Mrpl47Q8K2Y7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mrpl47Q8K2Y7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mrpl47Q8K2Y7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mrpl47Q8K2Y7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mrpl47Q8K2Y7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Mrpl47Q8K2Y7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mrpl47Q8K2Y7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mrpl47Q8K2Y7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mrpl47Q8K2Y7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mrpl47Q8K2Y7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mrpl47Q8K2Y7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mrpl47Q8K2Y7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Mrpl47Q8K2Y7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mrpl47Q8K2Y7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mrpl47Q8K2Y7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mrpl47Q8K2Y7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Mrpl47Q8K2Y7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mrpl47Q8K2Y7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mrpl47Q8K2Y7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mrpl47Q8K2Y7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mrpl47Q8K2Y7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mrpl47Q8K2Y7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Mrpl47Q8K2Y7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Mrpl47Q8K2Y7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mrpl47Q8K2Y7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Mrpl47Q8K2Y7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mrpl47Q8K2Y7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mrpl47Q8K2Y7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mrpl47Q8K2Y7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Mrpl47Q8K2Y7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mrpl47Q8K2Y7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mrpl47Q8K2Y7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mrpl47Q8K2Y7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mrpl47Q8K2Y7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mrpl47Q8K2Y7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mrpl47Q8K2Y7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mrpl47Q8K2Y7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mrpl47Q8K2Y7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms