Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y0

Rnf219, RING finger protein 219, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf219Q8K2Y0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf219Q8K2Y0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf219Q8K2Y0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf219Q8K2Y0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf219Q8K2Y0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf219Q8K2Y0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf219Q8K2Y0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf219Q8K2Y0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf219Q8K2Y0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf219Q8K2Y0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf219Q8K2Y0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf219Q8K2Y0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf219Q8K2Y0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf219Q8K2Y0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf219Q8K2Y0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf219Q8K2Y0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf219Q8K2Y0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf219Q8K2Y0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf219Q8K2Y0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf219Q8K2Y0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf219Q8K2Y0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf219Q8K2Y0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf219Q8K2Y0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf219Q8K2Y0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf219Q8K2Y0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf219Q8K2Y0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf219Q8K2Y0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf219Q8K2Y0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf219Q8K2Y0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf219Q8K2Y0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf219Q8K2Y0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf219Q8K2Y0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf219Q8K2Y0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf219Q8K2Y0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf219Q8K2Y0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf219Q8K2Y0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf219Q8K2Y0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf219Q8K2Y0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf219Q8K2Y0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf219Q8K2Y0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf219Q8K2Y0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf219Q8K2Y0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf219Q8K2Y0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf219Q8K2Y0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf219Q8K2Y0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf219Q8K2Y0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf219Q8K2Y0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf219Q8K2Y0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf219Q8K2Y0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf219Q8K2Y0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf219Q8K2Y0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf219Q8K2Y0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf219Q8K2Y0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf219Q8K2Y0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf219Q8K2Y0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf219Q8K2Y0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf219Q8K2Y0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf219Q8K2Y0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf219Q8K2Y0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf219Q8K2Y0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf219Q8K2Y0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf219Q8K2Y0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf219Q8K2Y0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf219Q8K2Y0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rnf219Q8K2Y0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf219Q8K2Y0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf219Q8K2Y0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf219Q8K2Y0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf219Q8K2Y0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf219Q8K2Y0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf219Q8K2Y0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf219Q8K2Y0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf219Q8K2Y0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf219Q8K2Y0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf219Q8K2Y0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf219Q8K2Y0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf219Q8K2Y0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf219Q8K2Y0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf219Q8K2Y0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf219Q8K2Y0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf219Q8K2Y0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf219Q8K2Y0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf219Q8K2Y0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf219Q8K2Y0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf219Q8K2Y0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf219Q8K2Y0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf219Q8K2Y0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf219Q8K2Y0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf219Q8K2Y0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf219Q8K2Y0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf219Q8K2Y0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf219Q8K2Y0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf219Q8K2Y0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf219Q8K2Y0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf219Q8K2Y0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf219Q8K2Y0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf219Q8K2Y0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf219Q8K2Y0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf219Q8K2Y0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf219Q8K2Y0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms