Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X8

Gtf2h5, General transcription factor IIH subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2h5Q8K2X8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf2h5Q8K2X8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf2h5Q8K2X8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf2h5Q8K2X8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2h5Q8K2X8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2h5Q8K2X8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2h5Q8K2X8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2h5Q8K2X8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2h5Q8K2X8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2h5Q8K2X8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2h5Q8K2X8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf2h5Q8K2X8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2h5Q8K2X8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2h5Q8K2X8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2h5Q8K2X8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2h5Q8K2X8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2h5Q8K2X8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2h5Q8K2X8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf2h5Q8K2X8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2h5Q8K2X8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2h5Q8K2X8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2h5Q8K2X8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2h5Q8K2X8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2h5Q8K2X8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2h5Q8K2X8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2h5Q8K2X8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2h5Q8K2X8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2h5Q8K2X8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2h5Q8K2X8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2h5Q8K2X8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2h5Q8K2X8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2h5Q8K2X8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2h5Q8K2X8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2h5Q8K2X8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2h5Q8K2X8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2h5Q8K2X8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2h5Q8K2X8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2h5Q8K2X8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2h5Q8K2X8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2h5Q8K2X8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2h5Q8K2X8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2h5Q8K2X8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2h5Q8K2X8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2h5Q8K2X8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2h5Q8K2X8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2h5Q8K2X8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2h5Q8K2X8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2h5Q8K2X8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2h5Q8K2X8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gtf2h5Q8K2X8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gtf2h5Q8K2X8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gtf2h5Q8K2X8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gtf2h5Q8K2X8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2h5Q8K2X8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2h5Q8K2X8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2h5Q8K2X8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2h5Q8K2X8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2h5Q8K2X8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2h5Q8K2X8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2h5Q8K2X8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2h5Q8K2X8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2h5Q8K2X8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2h5Q8K2X8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2h5Q8K2X8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2h5Q8K2X8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2h5Q8K2X8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2h5Q8K2X8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf2h5Q8K2X8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2h5Q8K2X8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2h5Q8K2X8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2h5Q8K2X8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2h5Q8K2X8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf2h5Q8K2X8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2h5Q8K2X8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2h5Q8K2X8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2h5Q8K2X8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2h5Q8K2X8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2h5Q8K2X8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2h5Q8K2X8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2h5Q8K2X8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2h5Q8K2X8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2h5Q8K2X8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2h5Q8K2X8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2h5Q8K2X8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2h5Q8K2X8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2h5Q8K2X8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2h5Q8K2X8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2h5Q8K2X8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2h5Q8K2X8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2h5Q8K2X8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2h5Q8K2X8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2h5Q8K2X8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2h5Q8K2X8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2h5Q8K2X8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2h5Q8K2X8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2h5Q8K2X8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2h5Q8K2X8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2h5Q8K2X8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2h5Q8K2X8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2h5Q8K2X8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms