Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Q5

Chchd7, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd7Q8K2Q5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chchd7Q8K2Q5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chchd7Q8K2Q5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chchd7Q8K2Q5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chchd7Q8K2Q5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chchd7Q8K2Q5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chchd7Q8K2Q5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chchd7Q8K2Q5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chchd7Q8K2Q5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chchd7Q8K2Q5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chchd7Q8K2Q5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chchd7Q8K2Q5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chchd7Q8K2Q5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chchd7Q8K2Q5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chchd7Q8K2Q5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chchd7Q8K2Q5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Chchd7Q8K2Q5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chchd7Q8K2Q5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chchd7Q8K2Q5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chchd7Q8K2Q5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chchd7Q8K2Q5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chchd7Q8K2Q5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chchd7Q8K2Q5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chchd7Q8K2Q5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chchd7Q8K2Q5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chchd7Q8K2Q5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chchd7Q8K2Q5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chchd7Q8K2Q5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chchd7Q8K2Q5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chchd7Q8K2Q5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chchd7Q8K2Q5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chchd7Q8K2Q5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chchd7Q8K2Q5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chchd7Q8K2Q5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chchd7Q8K2Q5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chchd7Q8K2Q5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Chchd7Q8K2Q5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chchd7Q8K2Q5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chchd7Q8K2Q5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Chchd7Q8K2Q5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chchd7Q8K2Q5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chchd7Q8K2Q5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chchd7Q8K2Q5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Chchd7Q8K2Q5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chchd7Q8K2Q5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chchd7Q8K2Q5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chchd7Q8K2Q5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chchd7Q8K2Q5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chchd7Q8K2Q5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chchd7Q8K2Q5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chchd7Q8K2Q5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chchd7Q8K2Q5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chchd7Q8K2Q5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chchd7Q8K2Q5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chchd7Q8K2Q5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chchd7Q8K2Q5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Chchd7Q8K2Q5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chchd7Q8K2Q5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chchd7Q8K2Q5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chchd7Q8K2Q5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chchd7Q8K2Q5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chchd7Q8K2Q5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chchd7Q8K2Q5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Chchd7Q8K2Q5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chchd7Q8K2Q5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chchd7Q8K2Q5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chchd7Q8K2Q5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chchd7Q8K2Q5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chchd7Q8K2Q5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chchd7Q8K2Q5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chchd7Q8K2Q5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chchd7Q8K2Q5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chchd7Q8K2Q5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chchd7Q8K2Q5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chchd7Q8K2Q5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chchd7Q8K2Q5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chchd7Q8K2Q5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chchd7Q8K2Q5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chchd7Q8K2Q5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chchd7Q8K2Q5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chchd7Q8K2Q5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Chchd7Q8K2Q5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chchd7Q8K2Q5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chchd7Q8K2Q5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chchd7Q8K2Q5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chchd7Q8K2Q5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chchd7Q8K2Q5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chchd7Q8K2Q5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chchd7Q8K2Q5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chchd7Q8K2Q5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chchd7Q8K2Q5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chchd7Q8K2Q5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chchd7Q8K2Q5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chchd7Q8K2Q5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chchd7Q8K2Q5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chchd7Q8K2Q5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chchd7Q8K2Q5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Chchd7Q8K2Q5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chchd7Q8K2Q5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chchd7Q8K2Q5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.8 ms