Protein–RNA interactions for Protein: Q8K203

Neil3, Endonuclease 8-like 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil3Q8K203 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Neil3Q8K203 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Neil3Q8K203 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Neil3Q8K203 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Neil3Q8K203 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Neil3Q8K203 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Neil3Q8K203 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Neil3Q8K203 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Neil3Q8K203 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Neil3Q8K203 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Neil3Q8K203 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Neil3Q8K203 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Neil3Q8K203 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Neil3Q8K203 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Neil3Q8K203 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Neil3Q8K203 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Neil3Q8K203 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Neil3Q8K203 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Neil3Q8K203 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Neil3Q8K203 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Neil3Q8K203 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Neil3Q8K203 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Neil3Q8K203 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Neil3Q8K203 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Neil3Q8K203 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Neil3Q8K203 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Neil3Q8K203 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Neil3Q8K203 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Neil3Q8K203 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Neil3Q8K203 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Neil3Q8K203 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Neil3Q8K203 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Neil3Q8K203 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Neil3Q8K203 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Neil3Q8K203 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Neil3Q8K203 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Neil3Q8K203 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Neil3Q8K203 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Neil3Q8K203 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Neil3Q8K203 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Neil3Q8K203 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Neil3Q8K203 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Neil3Q8K203 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Neil3Q8K203 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Neil3Q8K203 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Neil3Q8K203 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Neil3Q8K203 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Neil3Q8K203 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Neil3Q8K203 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Neil3Q8K203 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Neil3Q8K203 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Neil3Q8K203 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Neil3Q8K203 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Neil3Q8K203 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Neil3Q8K203 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Neil3Q8K203 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Neil3Q8K203 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Neil3Q8K203 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Neil3Q8K203 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Neil3Q8K203 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Neil3Q8K203 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Neil3Q8K203 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Neil3Q8K203 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Neil3Q8K203 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Neil3Q8K203 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Neil3Q8K203 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Neil3Q8K203 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Neil3Q8K203 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Neil3Q8K203 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Neil3Q8K203 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Neil3Q8K203 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Neil3Q8K203 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Neil3Q8K203 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Neil3Q8K203 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Neil3Q8K203 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Neil3Q8K203 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Neil3Q8K203 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Neil3Q8K203 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Neil3Q8K203 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Neil3Q8K203 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Neil3Q8K203 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Neil3Q8K203 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Neil3Q8K203 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Neil3Q8K203 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Neil3Q8K203 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Neil3Q8K203 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Neil3Q8K203 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Neil3Q8K203 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Neil3Q8K203 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Neil3Q8K203 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Neil3Q8K203 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Neil3Q8K203 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Neil3Q8K203 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Neil3Q8K203 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Neil3Q8K203 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Neil3Q8K203 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Neil3Q8K203 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Neil3Q8K203 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Neil3Q8K203 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Neil3Q8K203 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms