Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sde2Q8K1J5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sde2Q8K1J5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sde2Q8K1J5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sde2Q8K1J5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sde2Q8K1J5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sde2Q8K1J5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sde2Q8K1J5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sde2Q8K1J5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sde2Q8K1J5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sde2Q8K1J5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Sde2Q8K1J5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Sde2Q8K1J5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Sde2Q8K1J5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sde2Q8K1J5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sde2Q8K1J5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sde2Q8K1J5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sde2Q8K1J5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sde2Q8K1J5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Sde2Q8K1J5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sde2Q8K1J5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sde2Q8K1J5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sde2Q8K1J5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Sde2Q8K1J5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sde2Q8K1J5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sde2Q8K1J5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sde2Q8K1J5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sde2Q8K1J5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sde2Q8K1J5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sde2Q8K1J5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sde2Q8K1J5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sde2Q8K1J5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sde2Q8K1J5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sde2Q8K1J5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sde2Q8K1J5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sde2Q8K1J5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sde2Q8K1J5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Sde2Q8K1J5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sde2Q8K1J5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sde2Q8K1J5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sde2Q8K1J5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sde2Q8K1J5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sde2Q8K1J5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sde2Q8K1J5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sde2Q8K1J5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sde2Q8K1J5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sde2Q8K1J5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sde2Q8K1J5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sde2Q8K1J5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Sde2Q8K1J5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Sde2Q8K1J5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sde2Q8K1J5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sde2Q8K1J5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sde2Q8K1J5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sde2Q8K1J5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sde2Q8K1J5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sde2Q8K1J5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Sde2Q8K1J5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sde2Q8K1J5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sde2Q8K1J5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sde2Q8K1J5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sde2Q8K1J5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sde2Q8K1J5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sde2Q8K1J5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Sde2Q8K1J5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sde2Q8K1J5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Sde2Q8K1J5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sde2Q8K1J5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sde2Q8K1J5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sde2Q8K1J5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sde2Q8K1J5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sde2Q8K1J5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sde2Q8K1J5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sde2Q8K1J5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sde2Q8K1J5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sde2Q8K1J5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sde2Q8K1J5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Sde2Q8K1J5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sde2Q8K1J5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sde2Q8K1J5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sde2Q8K1J5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sde2Q8K1J5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sde2Q8K1J5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sde2Q8K1J5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sde2Q8K1J5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sde2Q8K1J5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sde2Q8K1J5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sde2Q8K1J5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sde2Q8K1J5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sde2Q8K1J5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sde2Q8K1J5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Sde2Q8K1J5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sde2Q8K1J5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sde2Q8K1J5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sde2Q8K1J5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sde2Q8K1J5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sde2Q8K1J5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sde2Q8K1J5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sde2Q8K1J5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Sde2Q8K1J5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms