Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E3

Slc5a11, Sodium/myo-inositol cotransporter 2, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a11Q8K0E3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc5a11Q8K0E3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc5a11Q8K0E3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc5a11Q8K0E3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc5a11Q8K0E3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc5a11Q8K0E3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc5a11Q8K0E3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc5a11Q8K0E3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc5a11Q8K0E3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc5a11Q8K0E3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc5a11Q8K0E3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc5a11Q8K0E3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc5a11Q8K0E3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc5a11Q8K0E3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc5a11Q8K0E3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc5a11Q8K0E3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc5a11Q8K0E3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc5a11Q8K0E3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc5a11Q8K0E3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc5a11Q8K0E3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc5a11Q8K0E3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc5a11Q8K0E3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc5a11Q8K0E3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc5a11Q8K0E3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc5a11Q8K0E3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc5a11Q8K0E3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc5a11Q8K0E3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc5a11Q8K0E3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc5a11Q8K0E3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc5a11Q8K0E3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc5a11Q8K0E3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc5a11Q8K0E3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc5a11Q8K0E3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc5a11Q8K0E3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc5a11Q8K0E3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc5a11Q8K0E3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc5a11Q8K0E3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc5a11Q8K0E3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc5a11Q8K0E3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc5a11Q8K0E3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc5a11Q8K0E3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc5a11Q8K0E3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc5a11Q8K0E3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc5a11Q8K0E3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc5a11Q8K0E3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc5a11Q8K0E3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc5a11Q8K0E3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc5a11Q8K0E3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc5a11Q8K0E3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc5a11Q8K0E3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc5a11Q8K0E3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc5a11Q8K0E3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc5a11Q8K0E3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc5a11Q8K0E3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc5a11Q8K0E3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc5a11Q8K0E3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc5a11Q8K0E3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc5a11Q8K0E3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc5a11Q8K0E3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc5a11Q8K0E3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc5a11Q8K0E3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc5a11Q8K0E3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc5a11Q8K0E3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc5a11Q8K0E3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc5a11Q8K0E3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc5a11Q8K0E3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc5a11Q8K0E3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc5a11Q8K0E3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc5a11Q8K0E3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc5a11Q8K0E3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc5a11Q8K0E3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc5a11Q8K0E3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc5a11Q8K0E3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc5a11Q8K0E3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc5a11Q8K0E3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc5a11Q8K0E3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc5a11Q8K0E3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc5a11Q8K0E3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc5a11Q8K0E3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc5a11Q8K0E3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc5a11Q8K0E3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc5a11Q8K0E3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc5a11Q8K0E3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc5a11Q8K0E3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc5a11Q8K0E3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc5a11Q8K0E3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc5a11Q8K0E3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc5a11Q8K0E3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc5a11Q8K0E3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc5a11Q8K0E3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc5a11Q8K0E3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc5a11Q8K0E3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc5a11Q8K0E3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Slc5a11Q8K0E3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Slc5a11Q8K0E3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc5a11Q8K0E3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc5a11Q8K0E3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc5a11Q8K0E3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc5a11Q8K0E3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc5a11Q8K0E3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms