Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E3

Slc5a11, Sodium/myo-inositol cotransporter 2, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a11Q8K0E3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc5a11Q8K0E3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc5a11Q8K0E3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc5a11Q8K0E3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc5a11Q8K0E3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc5a11Q8K0E3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc5a11Q8K0E3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc5a11Q8K0E3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc5a11Q8K0E3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc5a11Q8K0E3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc5a11Q8K0E3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc5a11Q8K0E3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc5a11Q8K0E3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc5a11Q8K0E3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc5a11Q8K0E3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc5a11Q8K0E3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc5a11Q8K0E3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc5a11Q8K0E3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc5a11Q8K0E3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc5a11Q8K0E3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc5a11Q8K0E3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc5a11Q8K0E3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc5a11Q8K0E3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc5a11Q8K0E3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc5a11Q8K0E3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc5a11Q8K0E3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc5a11Q8K0E3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc5a11Q8K0E3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc5a11Q8K0E3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc5a11Q8K0E3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc5a11Q8K0E3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc5a11Q8K0E3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc5a11Q8K0E3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc5a11Q8K0E3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc5a11Q8K0E3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc5a11Q8K0E3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc5a11Q8K0E3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc5a11Q8K0E3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc5a11Q8K0E3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc5a11Q8K0E3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc5a11Q8K0E3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc5a11Q8K0E3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc5a11Q8K0E3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc5a11Q8K0E3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc5a11Q8K0E3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc5a11Q8K0E3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc5a11Q8K0E3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc5a11Q8K0E3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc5a11Q8K0E3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc5a11Q8K0E3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc5a11Q8K0E3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc5a11Q8K0E3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc5a11Q8K0E3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc5a11Q8K0E3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc5a11Q8K0E3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc5a11Q8K0E3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc5a11Q8K0E3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc5a11Q8K0E3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc5a11Q8K0E3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc5a11Q8K0E3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc5a11Q8K0E3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc5a11Q8K0E3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc5a11Q8K0E3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc5a11Q8K0E3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc5a11Q8K0E3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc5a11Q8K0E3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc5a11Q8K0E3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc5a11Q8K0E3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc5a11Q8K0E3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc5a11Q8K0E3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc5a11Q8K0E3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc5a11Q8K0E3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc5a11Q8K0E3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc5a11Q8K0E3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc5a11Q8K0E3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc5a11Q8K0E3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc5a11Q8K0E3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc5a11Q8K0E3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc5a11Q8K0E3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc5a11Q8K0E3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc5a11Q8K0E3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc5a11Q8K0E3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc5a11Q8K0E3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc5a11Q8K0E3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc5a11Q8K0E3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc5a11Q8K0E3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc5a11Q8K0E3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc5a11Q8K0E3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc5a11Q8K0E3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc5a11Q8K0E3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc5a11Q8K0E3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc5a11Q8K0E3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc5a11Q8K0E3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Slc5a11Q8K0E3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Slc5a11Q8K0E3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc5a11Q8K0E3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc5a11Q8K0E3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc5a11Q8K0E3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc5a11Q8K0E3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc5a11Q8K0E3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms