Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0B2

Lmbrd1, Probable lysosomal cobalamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd1Q8K0B2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Lmbrd1Q8K0B2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lmbrd1Q8K0B2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lmbrd1Q8K0B2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lmbrd1Q8K0B2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lmbrd1Q8K0B2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lmbrd1Q8K0B2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lmbrd1Q8K0B2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lmbrd1Q8K0B2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lmbrd1Q8K0B2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lmbrd1Q8K0B2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Lmbrd1Q8K0B2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Lmbrd1Q8K0B2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lmbrd1Q8K0B2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lmbrd1Q8K0B2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lmbrd1Q8K0B2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lmbrd1Q8K0B2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Lmbrd1Q8K0B2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Lmbrd1Q8K0B2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lmbrd1Q8K0B2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Lmbrd1Q8K0B2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lmbrd1Q8K0B2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lmbrd1Q8K0B2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lmbrd1Q8K0B2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Lmbrd1Q8K0B2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Lmbrd1Q8K0B2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lmbrd1Q8K0B2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lmbrd1Q8K0B2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lmbrd1Q8K0B2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lmbrd1Q8K0B2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lmbrd1Q8K0B2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lmbrd1Q8K0B2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lmbrd1Q8K0B2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lmbrd1Q8K0B2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lmbrd1Q8K0B2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lmbrd1Q8K0B2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lmbrd1Q8K0B2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Lmbrd1Q8K0B2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lmbrd1Q8K0B2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lmbrd1Q8K0B2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lmbrd1Q8K0B2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lmbrd1Q8K0B2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lmbrd1Q8K0B2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lmbrd1Q8K0B2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lmbrd1Q8K0B2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lmbrd1Q8K0B2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lmbrd1Q8K0B2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lmbrd1Q8K0B2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lmbrd1Q8K0B2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lmbrd1Q8K0B2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Lmbrd1Q8K0B2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lmbrd1Q8K0B2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lmbrd1Q8K0B2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lmbrd1Q8K0B2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lmbrd1Q8K0B2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Lmbrd1Q8K0B2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lmbrd1Q8K0B2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lmbrd1Q8K0B2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lmbrd1Q8K0B2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Lmbrd1Q8K0B2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lmbrd1Q8K0B2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lmbrd1Q8K0B2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lmbrd1Q8K0B2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lmbrd1Q8K0B2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lmbrd1Q8K0B2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lmbrd1Q8K0B2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Lmbrd1Q8K0B2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lmbrd1Q8K0B2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lmbrd1Q8K0B2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lmbrd1Q8K0B2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lmbrd1Q8K0B2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lmbrd1Q8K0B2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Lmbrd1Q8K0B2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lmbrd1Q8K0B2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lmbrd1Q8K0B2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lmbrd1Q8K0B2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Lmbrd1Q8K0B2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lmbrd1Q8K0B2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lmbrd1Q8K0B2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lmbrd1Q8K0B2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lmbrd1Q8K0B2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Lmbrd1Q8K0B2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lmbrd1Q8K0B2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lmbrd1Q8K0B2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lmbrd1Q8K0B2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lmbrd1Q8K0B2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lmbrd1Q8K0B2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lmbrd1Q8K0B2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Lmbrd1Q8K0B2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lmbrd1Q8K0B2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Lmbrd1Q8K0B2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Lmbrd1Q8K0B2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lmbrd1Q8K0B2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lmbrd1Q8K0B2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lmbrd1Q8K0B2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms