Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Lrit1Q8K099 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Lrit1Q8K099 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Lrit1Q8K099 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Lrit1Q8K099 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Lrit1Q8K099 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Lrit1Q8K099 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Lrit1Q8K099 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Lrit1Q8K099 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Lrit1Q8K099 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Lrit1Q8K099 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Lrit1Q8K099 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Lrit1Q8K099 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Lrit1Q8K099 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Lrit1Q8K099 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Lrit1Q8K099 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Lrit1Q8K099 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Lrit1Q8K099 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Lrit1Q8K099 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Lrit1Q8K099 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Lrit1Q8K099 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Lrit1Q8K099 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Lrit1Q8K099 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Lrit1Q8K099 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Lrit1Q8K099 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Lrit1Q8K099 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Lrit1Q8K099 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Lrit1Q8K099 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Lrit1Q8K099 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Lrit1Q8K099 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Lrit1Q8K099 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Lrit1Q8K099 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Lrit1Q8K099 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Lrit1Q8K099 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Lrit1Q8K099 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Lrit1Q8K099 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Lrit1Q8K099 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Lrit1Q8K099 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Lrit1Q8K099 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lrit1Q8K099 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lrit1Q8K099 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lrit1Q8K099 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lrit1Q8K099 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Lrit1Q8K099 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lrit1Q8K099 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lrit1Q8K099 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Lrit1Q8K099 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Lrit1Q8K099 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Lrit1Q8K099 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Lrit1Q8K099 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Lrit1Q8K099 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Lrit1Q8K099 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Lrit1Q8K099 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lrit1Q8K099 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Lrit1Q8K099 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Lrit1Q8K099 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Lrit1Q8K099 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Lrit1Q8K099 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Lrit1Q8K099 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Lrit1Q8K099 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Lrit1Q8K099 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Lrit1Q8K099 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Lrit1Q8K099 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Lrit1Q8K099 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Lrit1Q8K099 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Lrit1Q8K099 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Lrit1Q8K099 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Lrit1Q8K099 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Lrit1Q8K099 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Lrit1Q8K099 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Lrit1Q8K099 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Lrit1Q8K099 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Lrit1Q8K099 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Lrit1Q8K099 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Lrit1Q8K099 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Lrit1Q8K099 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Lrit1Q8K099 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Lrit1Q8K099 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Lrit1Q8K099 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Lrit1Q8K099 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Lrit1Q8K099 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Lrit1Q8K099 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Lrit1Q8K099 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Lrit1Q8K099 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lrit1Q8K099 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lrit1Q8K099 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lrit1Q8K099 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lrit1Q8K099 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lrit1Q8K099 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lrit1Q8K099 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lrit1Q8K099 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Lrit1Q8K099 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Lrit1Q8K099 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Lrit1Q8K099 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Lrit1Q8K099 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Lrit1Q8K099 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Lrit1Q8K099 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Lrit1Q8K099 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Lrit1Q8K099 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Lrit1Q8K099 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms