Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rasgef1bQ8JZL7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rasgef1bQ8JZL7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rasgef1bQ8JZL7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rasgef1bQ8JZL7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rasgef1bQ8JZL7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rasgef1bQ8JZL7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rasgef1bQ8JZL7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rasgef1bQ8JZL7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rasgef1bQ8JZL7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rasgef1bQ8JZL7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rasgef1bQ8JZL7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rasgef1bQ8JZL7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rasgef1bQ8JZL7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rasgef1bQ8JZL7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rasgef1bQ8JZL7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rasgef1bQ8JZL7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rasgef1bQ8JZL7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rasgef1bQ8JZL7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rasgef1bQ8JZL7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rasgef1bQ8JZL7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rasgef1bQ8JZL7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rasgef1bQ8JZL7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rasgef1bQ8JZL7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rasgef1bQ8JZL7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rasgef1bQ8JZL7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rasgef1bQ8JZL7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rasgef1bQ8JZL7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rasgef1bQ8JZL7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rasgef1bQ8JZL7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rasgef1bQ8JZL7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rasgef1bQ8JZL7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rasgef1bQ8JZL7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rasgef1bQ8JZL7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rasgef1bQ8JZL7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rasgef1bQ8JZL7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rasgef1bQ8JZL7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rasgef1bQ8JZL7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rasgef1bQ8JZL7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rasgef1bQ8JZL7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rasgef1bQ8JZL7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rasgef1bQ8JZL7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rasgef1bQ8JZL7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rasgef1bQ8JZL7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rasgef1bQ8JZL7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rasgef1bQ8JZL7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rasgef1bQ8JZL7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rasgef1bQ8JZL7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rasgef1bQ8JZL7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rasgef1bQ8JZL7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rasgef1bQ8JZL7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rasgef1bQ8JZL7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rasgef1bQ8JZL7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rasgef1bQ8JZL7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rasgef1bQ8JZL7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rasgef1bQ8JZL7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rasgef1bQ8JZL7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rasgef1bQ8JZL7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rasgef1bQ8JZL7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rasgef1bQ8JZL7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rasgef1bQ8JZL7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rasgef1bQ8JZL7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rasgef1bQ8JZL7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rasgef1bQ8JZL7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rasgef1bQ8JZL7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Rasgef1bQ8JZL7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rasgef1bQ8JZL7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rasgef1bQ8JZL7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rasgef1bQ8JZL7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rasgef1bQ8JZL7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rasgef1bQ8JZL7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rasgef1bQ8JZL7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rasgef1bQ8JZL7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rasgef1bQ8JZL7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rasgef1bQ8JZL7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rasgef1bQ8JZL7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Rasgef1bQ8JZL7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rasgef1bQ8JZL7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rasgef1bQ8JZL7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rasgef1bQ8JZL7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rasgef1bQ8JZL7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rasgef1bQ8JZL7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rasgef1bQ8JZL7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rasgef1bQ8JZL7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rasgef1bQ8JZL7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rasgef1bQ8JZL7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rasgef1bQ8JZL7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rasgef1bQ8JZL7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rasgef1bQ8JZL7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rasgef1bQ8JZL7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rasgef1bQ8JZL7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rasgef1bQ8JZL7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rasgef1bQ8JZL7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rasgef1bQ8JZL7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rasgef1bQ8JZL7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rasgef1bQ8JZL7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rasgef1bQ8JZL7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rasgef1bQ8JZL7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms