Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIR4

Trpm6, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 6, mousemouse

Predictions only

Length 2,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm6Q8CIR4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Trpm6Q8CIR4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpm6Q8CIR4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpm6Q8CIR4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpm6Q8CIR4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpm6Q8CIR4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpm6Q8CIR4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpm6Q8CIR4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpm6Q8CIR4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpm6Q8CIR4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpm6Q8CIR4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpm6Q8CIR4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpm6Q8CIR4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpm6Q8CIR4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpm6Q8CIR4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpm6Q8CIR4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpm6Q8CIR4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpm6Q8CIR4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpm6Q8CIR4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpm6Q8CIR4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpm6Q8CIR4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpm6Q8CIR4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpm6Q8CIR4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpm6Q8CIR4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpm6Q8CIR4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpm6Q8CIR4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpm6Q8CIR4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpm6Q8CIR4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpm6Q8CIR4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpm6Q8CIR4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpm6Q8CIR4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpm6Q8CIR4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpm6Q8CIR4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpm6Q8CIR4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpm6Q8CIR4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpm6Q8CIR4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpm6Q8CIR4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpm6Q8CIR4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trpm6Q8CIR4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trpm6Q8CIR4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Trpm6Q8CIR4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trpm6Q8CIR4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trpm6Q8CIR4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trpm6Q8CIR4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trpm6Q8CIR4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trpm6Q8CIR4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Trpm6Q8CIR4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpm6Q8CIR4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpm6Q8CIR4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpm6Q8CIR4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpm6Q8CIR4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpm6Q8CIR4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpm6Q8CIR4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpm6Q8CIR4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpm6Q8CIR4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpm6Q8CIR4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpm6Q8CIR4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpm6Q8CIR4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpm6Q8CIR4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpm6Q8CIR4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpm6Q8CIR4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpm6Q8CIR4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpm6Q8CIR4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpm6Q8CIR4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpm6Q8CIR4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpm6Q8CIR4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpm6Q8CIR4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpm6Q8CIR4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpm6Q8CIR4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpm6Q8CIR4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpm6Q8CIR4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpm6Q8CIR4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpm6Q8CIR4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Trpm6Q8CIR4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trpm6Q8CIR4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trpm6Q8CIR4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trpm6Q8CIR4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trpm6Q8CIR4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trpm6Q8CIR4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trpm6Q8CIR4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trpm6Q8CIR4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trpm6Q8CIR4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpm6Q8CIR4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpm6Q8CIR4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpm6Q8CIR4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpm6Q8CIR4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpm6Q8CIR4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpm6Q8CIR4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpm6Q8CIR4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpm6Q8CIR4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpm6Q8CIR4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpm6Q8CIR4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpm6Q8CIR4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpm6Q8CIR4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpm6Q8CIR4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpm6Q8CIR4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpm6Q8CIR4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpm6Q8CIR4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpm6Q8CIR4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpm6Q8CIR4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms