Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI52

Gramd1c, GRAM domain-containing protein 1C, mousemouse

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Length 457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gramd1cQ8CI52 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gramd1cQ8CI52 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gramd1cQ8CI52 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gramd1cQ8CI52 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gramd1cQ8CI52 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gramd1cQ8CI52 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gramd1cQ8CI52 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gramd1cQ8CI52 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gramd1cQ8CI52 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gramd1cQ8CI52 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gramd1cQ8CI52 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gramd1cQ8CI52 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gramd1cQ8CI52 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gramd1cQ8CI52 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gramd1cQ8CI52 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gramd1cQ8CI52 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gramd1cQ8CI52 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gramd1cQ8CI52 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gramd1cQ8CI52 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gramd1cQ8CI52 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gramd1cQ8CI52 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gramd1cQ8CI52 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gramd1cQ8CI52 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gramd1cQ8CI52 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gramd1cQ8CI52 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gramd1cQ8CI52 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Gramd1cQ8CI52 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gramd1cQ8CI52 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gramd1cQ8CI52 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gramd1cQ8CI52 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gramd1cQ8CI52 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gramd1cQ8CI52 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gramd1cQ8CI52 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gramd1cQ8CI52 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gramd1cQ8CI52 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gramd1cQ8CI52 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gramd1cQ8CI52 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gramd1cQ8CI52 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gramd1cQ8CI52 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gramd1cQ8CI52 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gramd1cQ8CI52 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gramd1cQ8CI52 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gramd1cQ8CI52 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gramd1cQ8CI52 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gramd1cQ8CI52 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gramd1cQ8CI52 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gramd1cQ8CI52 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gramd1cQ8CI52 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gramd1cQ8CI52 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gramd1cQ8CI52 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gramd1cQ8CI52 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gramd1cQ8CI52 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gramd1cQ8CI52 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gramd1cQ8CI52 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gramd1cQ8CI52 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gramd1cQ8CI52 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gramd1cQ8CI52 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gramd1cQ8CI52 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gramd1cQ8CI52 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gramd1cQ8CI52 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gramd1cQ8CI52 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gramd1cQ8CI52 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gramd1cQ8CI52 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gramd1cQ8CI52 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gramd1cQ8CI52 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gramd1cQ8CI52 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gramd1cQ8CI52 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gramd1cQ8CI52 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gramd1cQ8CI52 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Gramd1cQ8CI52 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gramd1cQ8CI52 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gramd1cQ8CI52 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gramd1cQ8CI52 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gramd1cQ8CI52 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gramd1cQ8CI52 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gramd1cQ8CI52 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gramd1cQ8CI52 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gramd1cQ8CI52 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gramd1cQ8CI52 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gramd1cQ8CI52 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gramd1cQ8CI52 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gramd1cQ8CI52 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gramd1cQ8CI52 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Gramd1cQ8CI52 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Gramd1cQ8CI52 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gramd1cQ8CI52 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gramd1cQ8CI52 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gramd1cQ8CI52 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gramd1cQ8CI52 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gramd1cQ8CI52 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gramd1cQ8CI52 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gramd1cQ8CI52 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gramd1cQ8CI52 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gramd1cQ8CI52 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gramd1cQ8CI52 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gramd1cQ8CI52 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gramd1cQ8CI52 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gramd1cQ8CI52 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gramd1cQ8CI52 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Gramd1cQ8CI52 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms