Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHG7

Rapgef2, Rap guanine nucleotide exchange factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef2Q8CHG7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Rapgef2Q8CHG7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Rapgef2Q8CHG7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Rapgef2Q8CHG7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Rapgef2Q8CHG7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Rapgef2Q8CHG7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Rapgef2Q8CHG7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Rapgef2Q8CHG7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Rapgef2Q8CHG7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Rapgef2Q8CHG7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.44
Rapgef2Q8CHG7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Rapgef2Q8CHG7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Rapgef2Q8CHG7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
Rapgef2Q8CHG7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Rapgef2Q8CHG7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Rapgef2Q8CHG7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Rapgef2Q8CHG7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Rapgef2Q8CHG7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Rapgef2Q8CHG7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Rapgef2Q8CHG7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Rapgef2Q8CHG7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Rapgef2Q8CHG7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Rapgef2Q8CHG7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Rapgef2Q8CHG7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Rapgef2Q8CHG7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Rapgef2Q8CHG7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Rapgef2Q8CHG7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Rapgef2Q8CHG7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
Rapgef2Q8CHG7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Rapgef2Q8CHG7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
Rapgef2Q8CHG7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Rapgef2Q8CHG7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Rapgef2Q8CHG7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
Rapgef2Q8CHG7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Rapgef2Q8CHG7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Rapgef2Q8CHG7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Rapgef2Q8CHG7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Rapgef2Q8CHG7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Rapgef2Q8CHG7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Rapgef2Q8CHG7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Rapgef2Q8CHG7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
Rapgef2Q8CHG7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Rapgef2Q8CHG7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Rapgef2Q8CHG7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
Rapgef2Q8CHG7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Rapgef2Q8CHG7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Rapgef2Q8CHG7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Rapgef2Q8CHG7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Rapgef2Q8CHG7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Rapgef2Q8CHG7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Rapgef2Q8CHG7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Rapgef2Q8CHG7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Rapgef2Q8CHG7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Rapgef2Q8CHG7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Rapgef2Q8CHG7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Rapgef2Q8CHG7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Rapgef2Q8CHG7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Rapgef2Q8CHG7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Rapgef2Q8CHG7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Rapgef2Q8CHG7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Rapgef2Q8CHG7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Rapgef2Q8CHG7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
Rapgef2Q8CHG7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Rapgef2Q8CHG7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Rapgef2Q8CHG7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
Rapgef2Q8CHG7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
Rapgef2Q8CHG7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Rapgef2Q8CHG7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Rapgef2Q8CHG7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Rapgef2Q8CHG7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Rapgef2Q8CHG7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Rapgef2Q8CHG7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Rapgef2Q8CHG7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Rapgef2Q8CHG7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Rapgef2Q8CHG7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Rapgef2Q8CHG7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Rapgef2Q8CHG7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Rapgef2Q8CHG7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Rapgef2Q8CHG7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Rapgef2Q8CHG7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Rapgef2Q8CHG7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Rapgef2Q8CHG7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Rapgef2Q8CHG7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Rapgef2Q8CHG7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Rapgef2Q8CHG7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Rapgef2Q8CHG7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Rapgef2Q8CHG7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Rapgef2Q8CHG7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Rapgef2Q8CHG7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Rapgef2Q8CHG7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Rapgef2Q8CHG7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Rapgef2Q8CHG7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Rapgef2Q8CHG7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Rapgef2Q8CHG7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
Rapgef2Q8CHG7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Rapgef2Q8CHG7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Rapgef2Q8CHG7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Rapgef2Q8CHG7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Rapgef2Q8CHG7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Rapgef2Q8CHG7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms