Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGK3

Lonp1, Lon protease homolog, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonp1Q8CGK3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lonp1Q8CGK3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lonp1Q8CGK3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lonp1Q8CGK3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lonp1Q8CGK3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lonp1Q8CGK3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lonp1Q8CGK3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lonp1Q8CGK3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lonp1Q8CGK3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lonp1Q8CGK3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lonp1Q8CGK3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lonp1Q8CGK3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lonp1Q8CGK3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lonp1Q8CGK3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lonp1Q8CGK3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lonp1Q8CGK3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lonp1Q8CGK3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lonp1Q8CGK3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lonp1Q8CGK3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lonp1Q8CGK3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lonp1Q8CGK3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lonp1Q8CGK3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lonp1Q8CGK3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lonp1Q8CGK3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lonp1Q8CGK3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lonp1Q8CGK3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lonp1Q8CGK3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lonp1Q8CGK3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lonp1Q8CGK3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lonp1Q8CGK3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lonp1Q8CGK3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lonp1Q8CGK3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lonp1Q8CGK3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lonp1Q8CGK3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lonp1Q8CGK3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lonp1Q8CGK3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lonp1Q8CGK3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lonp1Q8CGK3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Lonp1Q8CGK3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Lonp1Q8CGK3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lonp1Q8CGK3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lonp1Q8CGK3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Lonp1Q8CGK3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lonp1Q8CGK3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lonp1Q8CGK3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lonp1Q8CGK3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lonp1Q8CGK3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lonp1Q8CGK3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lonp1Q8CGK3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lonp1Q8CGK3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lonp1Q8CGK3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lonp1Q8CGK3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lonp1Q8CGK3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lonp1Q8CGK3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lonp1Q8CGK3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lonp1Q8CGK3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lonp1Q8CGK3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lonp1Q8CGK3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lonp1Q8CGK3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lonp1Q8CGK3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lonp1Q8CGK3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lonp1Q8CGK3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lonp1Q8CGK3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Lonp1Q8CGK3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lonp1Q8CGK3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lonp1Q8CGK3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lonp1Q8CGK3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lonp1Q8CGK3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lonp1Q8CGK3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lonp1Q8CGK3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lonp1Q8CGK3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Lonp1Q8CGK3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lonp1Q8CGK3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lonp1Q8CGK3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lonp1Q8CGK3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lonp1Q8CGK3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lonp1Q8CGK3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lonp1Q8CGK3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lonp1Q8CGK3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lonp1Q8CGK3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lonp1Q8CGK3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lonp1Q8CGK3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lonp1Q8CGK3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lonp1Q8CGK3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lonp1Q8CGK3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lonp1Q8CGK3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lonp1Q8CGK3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lonp1Q8CGK3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lonp1Q8CGK3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Lonp1Q8CGK3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lonp1Q8CGK3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lonp1Q8CGK3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lonp1Q8CGK3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lonp1Q8CGK3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lonp1Q8CGK3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lonp1Q8CGK3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lonp1Q8CGK3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lonp1Q8CGK3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lonp1Q8CGK3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lonp1Q8CGK3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms