Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hpf1Q8CFE2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hpf1Q8CFE2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hpf1Q8CFE2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hpf1Q8CFE2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hpf1Q8CFE2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hpf1Q8CFE2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hpf1Q8CFE2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hpf1Q8CFE2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hpf1Q8CFE2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hpf1Q8CFE2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hpf1Q8CFE2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hpf1Q8CFE2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hpf1Q8CFE2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hpf1Q8CFE2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hpf1Q8CFE2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hpf1Q8CFE2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hpf1Q8CFE2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hpf1Q8CFE2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hpf1Q8CFE2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hpf1Q8CFE2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hpf1Q8CFE2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hpf1Q8CFE2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hpf1Q8CFE2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hpf1Q8CFE2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hpf1Q8CFE2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hpf1Q8CFE2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Hpf1Q8CFE2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hpf1Q8CFE2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hpf1Q8CFE2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Hpf1Q8CFE2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Hpf1Q8CFE2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hpf1Q8CFE2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Hpf1Q8CFE2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Hpf1Q8CFE2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hpf1Q8CFE2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hpf1Q8CFE2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hpf1Q8CFE2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hpf1Q8CFE2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hpf1Q8CFE2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hpf1Q8CFE2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hpf1Q8CFE2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hpf1Q8CFE2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hpf1Q8CFE2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hpf1Q8CFE2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hpf1Q8CFE2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hpf1Q8CFE2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hpf1Q8CFE2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hpf1Q8CFE2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hpf1Q8CFE2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hpf1Q8CFE2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hpf1Q8CFE2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hpf1Q8CFE2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hpf1Q8CFE2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hpf1Q8CFE2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hpf1Q8CFE2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hpf1Q8CFE2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Hpf1Q8CFE2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hpf1Q8CFE2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hpf1Q8CFE2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hpf1Q8CFE2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Hpf1Q8CFE2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hpf1Q8CFE2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hpf1Q8CFE2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hpf1Q8CFE2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hpf1Q8CFE2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hpf1Q8CFE2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hpf1Q8CFE2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hpf1Q8CFE2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hpf1Q8CFE2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hpf1Q8CFE2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hpf1Q8CFE2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Hpf1Q8CFE2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hpf1Q8CFE2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hpf1Q8CFE2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hpf1Q8CFE2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Hpf1Q8CFE2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hpf1Q8CFE2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hpf1Q8CFE2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hpf1Q8CFE2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hpf1Q8CFE2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hpf1Q8CFE2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hpf1Q8CFE2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hpf1Q8CFE2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hpf1Q8CFE2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hpf1Q8CFE2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hpf1Q8CFE2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hpf1Q8CFE2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hpf1Q8CFE2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hpf1Q8CFE2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hpf1Q8CFE2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hpf1Q8CFE2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hpf1Q8CFE2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hpf1Q8CFE2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Hpf1Q8CFE2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hpf1Q8CFE2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hpf1Q8CFE2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hpf1Q8CFE2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hpf1Q8CFE2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hpf1Q8CFE2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
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