Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdkl1Q8CEQ0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdkl1Q8CEQ0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdkl1Q8CEQ0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdkl1Q8CEQ0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdkl1Q8CEQ0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdkl1Q8CEQ0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdkl1Q8CEQ0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdkl1Q8CEQ0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdkl1Q8CEQ0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdkl1Q8CEQ0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdkl1Q8CEQ0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdkl1Q8CEQ0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdkl1Q8CEQ0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdkl1Q8CEQ0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdkl1Q8CEQ0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdkl1Q8CEQ0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdkl1Q8CEQ0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdkl1Q8CEQ0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdkl1Q8CEQ0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdkl1Q8CEQ0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdkl1Q8CEQ0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdkl1Q8CEQ0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdkl1Q8CEQ0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdkl1Q8CEQ0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdkl1Q8CEQ0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdkl1Q8CEQ0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdkl1Q8CEQ0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdkl1Q8CEQ0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdkl1Q8CEQ0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdkl1Q8CEQ0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdkl1Q8CEQ0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdkl1Q8CEQ0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdkl1Q8CEQ0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdkl1Q8CEQ0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdkl1Q8CEQ0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdkl1Q8CEQ0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdkl1Q8CEQ0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdkl1Q8CEQ0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdkl1Q8CEQ0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdkl1Q8CEQ0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdkl1Q8CEQ0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdkl1Q8CEQ0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cdkl1Q8CEQ0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdkl1Q8CEQ0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdkl1Q8CEQ0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdkl1Q8CEQ0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdkl1Q8CEQ0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdkl1Q8CEQ0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdkl1Q8CEQ0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdkl1Q8CEQ0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdkl1Q8CEQ0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdkl1Q8CEQ0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdkl1Q8CEQ0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdkl1Q8CEQ0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdkl1Q8CEQ0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdkl1Q8CEQ0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdkl1Q8CEQ0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdkl1Q8CEQ0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdkl1Q8CEQ0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdkl1Q8CEQ0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdkl1Q8CEQ0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdkl1Q8CEQ0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdkl1Q8CEQ0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdkl1Q8CEQ0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdkl1Q8CEQ0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdkl1Q8CEQ0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdkl1Q8CEQ0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdkl1Q8CEQ0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdkl1Q8CEQ0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdkl1Q8CEQ0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdkl1Q8CEQ0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdkl1Q8CEQ0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdkl1Q8CEQ0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdkl1Q8CEQ0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cdkl1Q8CEQ0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cdkl1Q8CEQ0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdkl1Q8CEQ0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdkl1Q8CEQ0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdkl1Q8CEQ0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdkl1Q8CEQ0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdkl1Q8CEQ0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdkl1Q8CEQ0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdkl1Q8CEQ0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdkl1Q8CEQ0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdkl1Q8CEQ0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdkl1Q8CEQ0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdkl1Q8CEQ0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms