Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDI2

Fbxo43, F-box only protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo43Q8CDI2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fbxo43Q8CDI2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fbxo43Q8CDI2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fbxo43Q8CDI2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fbxo43Q8CDI2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fbxo43Q8CDI2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fbxo43Q8CDI2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fbxo43Q8CDI2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Fbxo43Q8CDI2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fbxo43Q8CDI2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fbxo43Q8CDI2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fbxo43Q8CDI2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Fbxo43Q8CDI2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fbxo43Q8CDI2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fbxo43Q8CDI2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Fbxo43Q8CDI2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fbxo43Q8CDI2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fbxo43Q8CDI2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fbxo43Q8CDI2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Fbxo43Q8CDI2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fbxo43Q8CDI2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fbxo43Q8CDI2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fbxo43Q8CDI2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fbxo43Q8CDI2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fbxo43Q8CDI2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fbxo43Q8CDI2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fbxo43Q8CDI2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Fbxo43Q8CDI2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Fbxo43Q8CDI2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Fbxo43Q8CDI2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fbxo43Q8CDI2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fbxo43Q8CDI2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fbxo43Q8CDI2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fbxo43Q8CDI2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fbxo43Q8CDI2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fbxo43Q8CDI2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fbxo43Q8CDI2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fbxo43Q8CDI2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Fbxo43Q8CDI2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fbxo43Q8CDI2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Fbxo43Q8CDI2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fbxo43Q8CDI2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fbxo43Q8CDI2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fbxo43Q8CDI2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fbxo43Q8CDI2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fbxo43Q8CDI2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fbxo43Q8CDI2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fbxo43Q8CDI2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fbxo43Q8CDI2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fbxo43Q8CDI2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fbxo43Q8CDI2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Fbxo43Q8CDI2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fbxo43Q8CDI2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fbxo43Q8CDI2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fbxo43Q8CDI2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fbxo43Q8CDI2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fbxo43Q8CDI2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fbxo43Q8CDI2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fbxo43Q8CDI2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fbxo43Q8CDI2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Fbxo43Q8CDI2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fbxo43Q8CDI2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fbxo43Q8CDI2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fbxo43Q8CDI2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fbxo43Q8CDI2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fbxo43Q8CDI2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fbxo43Q8CDI2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fbxo43Q8CDI2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fbxo43Q8CDI2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fbxo43Q8CDI2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fbxo43Q8CDI2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fbxo43Q8CDI2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fbxo43Q8CDI2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fbxo43Q8CDI2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fbxo43Q8CDI2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fbxo43Q8CDI2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fbxo43Q8CDI2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fbxo43Q8CDI2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fbxo43Q8CDI2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fbxo43Q8CDI2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fbxo43Q8CDI2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fbxo43Q8CDI2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fbxo43Q8CDI2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fbxo43Q8CDI2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fbxo43Q8CDI2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fbxo43Q8CDI2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fbxo43Q8CDI2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fbxo43Q8CDI2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fbxo43Q8CDI2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fbxo43Q8CDI2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fbxo43Q8CDI2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fbxo43Q8CDI2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fbxo43Q8CDI2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Fbxo43Q8CDI2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Fbxo43Q8CDI2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fbxo43Q8CDI2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fbxo43Q8CDI2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fbxo43Q8CDI2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fbxo43Q8CDI2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fbxo43Q8CDI2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms