Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAL5

Gpc5, Glypican-5, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc5Q8CAL5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gpc5Q8CAL5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Gpc5Q8CAL5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gpc5Q8CAL5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gpc5Q8CAL5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gpc5Q8CAL5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gpc5Q8CAL5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gpc5Q8CAL5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gpc5Q8CAL5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gpc5Q8CAL5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gpc5Q8CAL5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gpc5Q8CAL5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gpc5Q8CAL5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gpc5Q8CAL5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gpc5Q8CAL5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gpc5Q8CAL5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gpc5Q8CAL5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gpc5Q8CAL5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gpc5Q8CAL5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gpc5Q8CAL5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gpc5Q8CAL5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gpc5Q8CAL5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gpc5Q8CAL5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gpc5Q8CAL5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gpc5Q8CAL5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gpc5Q8CAL5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gpc5Q8CAL5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gpc5Q8CAL5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gpc5Q8CAL5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gpc5Q8CAL5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gpc5Q8CAL5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gpc5Q8CAL5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gpc5Q8CAL5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gpc5Q8CAL5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gpc5Q8CAL5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gpc5Q8CAL5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gpc5Q8CAL5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gpc5Q8CAL5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gpc5Q8CAL5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gpc5Q8CAL5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gpc5Q8CAL5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gpc5Q8CAL5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gpc5Q8CAL5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gpc5Q8CAL5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gpc5Q8CAL5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gpc5Q8CAL5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gpc5Q8CAL5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gpc5Q8CAL5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gpc5Q8CAL5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gpc5Q8CAL5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gpc5Q8CAL5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gpc5Q8CAL5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gpc5Q8CAL5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gpc5Q8CAL5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gpc5Q8CAL5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gpc5Q8CAL5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gpc5Q8CAL5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Gpc5Q8CAL5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Gpc5Q8CAL5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gpc5Q8CAL5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Gpc5Q8CAL5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gpc5Q8CAL5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gpc5Q8CAL5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Gpc5Q8CAL5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gpc5Q8CAL5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gpc5Q8CAL5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gpc5Q8CAL5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gpc5Q8CAL5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gpc5Q8CAL5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gpc5Q8CAL5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gpc5Q8CAL5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gpc5Q8CAL5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gpc5Q8CAL5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gpc5Q8CAL5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gpc5Q8CAL5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gpc5Q8CAL5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gpc5Q8CAL5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gpc5Q8CAL5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gpc5Q8CAL5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gpc5Q8CAL5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gpc5Q8CAL5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gpc5Q8CAL5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gpc5Q8CAL5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gpc5Q8CAL5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gpc5Q8CAL5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gpc5Q8CAL5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gpc5Q8CAL5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gpc5Q8CAL5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gpc5Q8CAL5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gpc5Q8CAL5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gpc5Q8CAL5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gpc5Q8CAL5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Gpc5Q8CAL5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gpc5Q8CAL5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gpc5Q8CAL5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gpc5Q8CAL5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gpc5Q8CAL5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gpc5Q8CAL5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Gpc5Q8CAL5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gpc5Q8CAL5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms