Protein–RNA interactions for Protein: Q8C804

Spice1, Spindle and centriole-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spice1Q8C804 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Spice1Q8C804 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Spice1Q8C804 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Spice1Q8C804 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Spice1Q8C804 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Spice1Q8C804 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Spice1Q8C804 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Spice1Q8C804 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Spice1Q8C804 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Spice1Q8C804 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Spice1Q8C804 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Spice1Q8C804 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Spice1Q8C804 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Spice1Q8C804 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Spice1Q8C804 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Spice1Q8C804 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Spice1Q8C804 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Spice1Q8C804 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Spice1Q8C804 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Spice1Q8C804 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Spice1Q8C804 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Spice1Q8C804 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Spice1Q8C804 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Spice1Q8C804 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Spice1Q8C804 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Spice1Q8C804 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Spice1Q8C804 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Spice1Q8C804 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Spice1Q8C804 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Spice1Q8C804 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Spice1Q8C804 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Spice1Q8C804 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Spice1Q8C804 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Spice1Q8C804 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Spice1Q8C804 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Spice1Q8C804 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Spice1Q8C804 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Spice1Q8C804 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Spice1Q8C804 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Spice1Q8C804 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Spice1Q8C804 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Spice1Q8C804 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Spice1Q8C804 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Spice1Q8C804 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Spice1Q8C804 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Spice1Q8C804 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Spice1Q8C804 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Spice1Q8C804 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Spice1Q8C804 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Spice1Q8C804 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Spice1Q8C804 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Spice1Q8C804 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Spice1Q8C804 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Spice1Q8C804 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Spice1Q8C804 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Spice1Q8C804 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Spice1Q8C804 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Spice1Q8C804 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Spice1Q8C804 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Spice1Q8C804 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Spice1Q8C804 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Spice1Q8C804 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Spice1Q8C804 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Spice1Q8C804 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Spice1Q8C804 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Spice1Q8C804 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Spice1Q8C804 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Spice1Q8C804 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Spice1Q8C804 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Spice1Q8C804 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Spice1Q8C804 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Spice1Q8C804 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Spice1Q8C804 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Spice1Q8C804 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Spice1Q8C804 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Spice1Q8C804 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Spice1Q8C804 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Spice1Q8C804 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Spice1Q8C804 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Spice1Q8C804 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Spice1Q8C804 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Spice1Q8C804 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Spice1Q8C804 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Spice1Q8C804 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Spice1Q8C804 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Spice1Q8C804 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Spice1Q8C804 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Spice1Q8C804 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Spice1Q8C804 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Spice1Q8C804 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Spice1Q8C804 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Spice1Q8C804 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Spice1Q8C804 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Spice1Q8C804 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Spice1Q8C804 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Spice1Q8C804 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Spice1Q8C804 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Spice1Q8C804 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Spice1Q8C804 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spice1Q8C804 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms