Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp20Q8C6M1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp20Q8C6M1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp20Q8C6M1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp20Q8C6M1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp20Q8C6M1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp20Q8C6M1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp20Q8C6M1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp20Q8C6M1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp20Q8C6M1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp20Q8C6M1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp20Q8C6M1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp20Q8C6M1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp20Q8C6M1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp20Q8C6M1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp20Q8C6M1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp20Q8C6M1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp20Q8C6M1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp20Q8C6M1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp20Q8C6M1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp20Q8C6M1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp20Q8C6M1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp20Q8C6M1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp20Q8C6M1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp20Q8C6M1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp20Q8C6M1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp20Q8C6M1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp20Q8C6M1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Usp20Q8C6M1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Usp20Q8C6M1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Usp20Q8C6M1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp20Q8C6M1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp20Q8C6M1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp20Q8C6M1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp20Q8C6M1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp20Q8C6M1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp20Q8C6M1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp20Q8C6M1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp20Q8C6M1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp20Q8C6M1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp20Q8C6M1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp20Q8C6M1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp20Q8C6M1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp20Q8C6M1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp20Q8C6M1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp20Q8C6M1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp20Q8C6M1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp20Q8C6M1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp20Q8C6M1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp20Q8C6M1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp20Q8C6M1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp20Q8C6M1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp20Q8C6M1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp20Q8C6M1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Usp20Q8C6M1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp20Q8C6M1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp20Q8C6M1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp20Q8C6M1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp20Q8C6M1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp20Q8C6M1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp20Q8C6M1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp20Q8C6M1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp20Q8C6M1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp20Q8C6M1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp20Q8C6M1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp20Q8C6M1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp20Q8C6M1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp20Q8C6M1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp20Q8C6M1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp20Q8C6M1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp20Q8C6M1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp20Q8C6M1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp20Q8C6M1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp20Q8C6M1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp20Q8C6M1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp20Q8C6M1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp20Q8C6M1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp20Q8C6M1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp20Q8C6M1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp20Q8C6M1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp20Q8C6M1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp20Q8C6M1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp20Q8C6M1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp20Q8C6M1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp20Q8C6M1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp20Q8C6M1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp20Q8C6M1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp20Q8C6M1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp20Q8C6M1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp20Q8C6M1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp20Q8C6M1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp20Q8C6M1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp20Q8C6M1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp20Q8C6M1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp20Q8C6M1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp20Q8C6M1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp20Q8C6M1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp20Q8C6M1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp20Q8C6M1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp20Q8C6M1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
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