Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc113Q8C5T8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc113Q8C5T8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc113Q8C5T8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc113Q8C5T8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc113Q8C5T8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc113Q8C5T8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc113Q8C5T8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc113Q8C5T8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc113Q8C5T8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc113Q8C5T8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc113Q8C5T8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc113Q8C5T8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc113Q8C5T8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc113Q8C5T8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc113Q8C5T8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc113Q8C5T8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc113Q8C5T8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc113Q8C5T8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc113Q8C5T8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc113Q8C5T8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc113Q8C5T8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc113Q8C5T8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc113Q8C5T8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc113Q8C5T8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc113Q8C5T8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc113Q8C5T8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc113Q8C5T8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc113Q8C5T8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc113Q8C5T8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc113Q8C5T8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc113Q8C5T8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc113Q8C5T8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc113Q8C5T8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc113Q8C5T8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc113Q8C5T8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc113Q8C5T8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc113Q8C5T8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc113Q8C5T8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc113Q8C5T8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc113Q8C5T8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc113Q8C5T8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc113Q8C5T8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc113Q8C5T8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc113Q8C5T8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc113Q8C5T8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc113Q8C5T8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc113Q8C5T8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc113Q8C5T8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc113Q8C5T8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc113Q8C5T8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc113Q8C5T8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc113Q8C5T8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc113Q8C5T8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc113Q8C5T8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc113Q8C5T8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc113Q8C5T8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc113Q8C5T8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc113Q8C5T8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc113Q8C5T8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc113Q8C5T8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc113Q8C5T8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc113Q8C5T8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc113Q8C5T8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc113Q8C5T8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc113Q8C5T8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc113Q8C5T8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc113Q8C5T8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc113Q8C5T8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc113Q8C5T8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc113Q8C5T8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc113Q8C5T8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc113Q8C5T8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc113Q8C5T8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc113Q8C5T8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc113Q8C5T8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc113Q8C5T8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc113Q8C5T8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc113Q8C5T8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc113Q8C5T8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc113Q8C5T8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc113Q8C5T8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc113Q8C5T8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc113Q8C5T8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc113Q8C5T8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc113Q8C5T8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc113Q8C5T8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc113Q8C5T8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc113Q8C5T8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc113Q8C5T8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc113Q8C5T8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc113Q8C5T8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc113Q8C5T8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc113Q8C5T8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc113Q8C5T8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc113Q8C5T8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc113Q8C5T8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc113Q8C5T8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc113Q8C5T8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc113Q8C5T8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
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