Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1R3

Uncharacterized protein C17orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C1R3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q8C1R3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q8C1R3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q8C1R3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q8C1R3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Q8C1R3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q8C1R3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q8C1R3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q8C1R3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q8C1R3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q8C1R3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q8C1R3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q8C1R3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q8C1R3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Q8C1R3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q8C1R3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q8C1R3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q8C1R3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q8C1R3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Q8C1R3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q8C1R3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Q8C1R3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q8C1R3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q8C1R3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q8C1R3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q8C1R3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q8C1R3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q8C1R3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q8C1R3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q8C1R3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q8C1R3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q8C1R3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q8C1R3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q8C1R3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q8C1R3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q8C1R3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q8C1R3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q8C1R3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q8C1R3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q8C1R3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q8C1R3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Q8C1R3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q8C1R3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q8C1R3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q8C1R3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Q8C1R3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q8C1R3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Q8C1R3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q8C1R3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q8C1R3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Q8C1R3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q8C1R3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q8C1R3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q8C1R3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q8C1R3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q8C1R3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q8C1R3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q8C1R3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q8C1R3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Q8C1R3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q8C1R3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q8C1R3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q8C1R3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q8C1R3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q8C1R3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q8C1R3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Q8C1R3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Q8C1R3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q8C1R3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q8C1R3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q8C1R3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Q8C1R3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q8C1R3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q8C1R3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Q8C1R3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q8C1R3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Q8C1R3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q8C1R3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q8C1R3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q8C1R3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Q8C1R3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q8C1R3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q8C1R3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q8C1R3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q8C1R3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q8C1R3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q8C1R3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q8C1R3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q8C1R3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q8C1R3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q8C1R3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q8C1R3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q8C1R3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q8C1R3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q8C1R3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q8C1R3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q8C1R3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q8C1R3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q8C1R3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q8C1R3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms