Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1D8

Iws1, Protein IWS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iws1Q8C1D8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Iws1Q8C1D8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Iws1Q8C1D8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Iws1Q8C1D8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Iws1Q8C1D8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Iws1Q8C1D8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Iws1Q8C1D8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Iws1Q8C1D8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Iws1Q8C1D8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Iws1Q8C1D8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Iws1Q8C1D8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Iws1Q8C1D8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Iws1Q8C1D8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Iws1Q8C1D8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Iws1Q8C1D8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Iws1Q8C1D8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Iws1Q8C1D8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Iws1Q8C1D8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Iws1Q8C1D8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Iws1Q8C1D8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Iws1Q8C1D8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Iws1Q8C1D8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Iws1Q8C1D8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Iws1Q8C1D8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Iws1Q8C1D8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Iws1Q8C1D8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Iws1Q8C1D8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Iws1Q8C1D8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Iws1Q8C1D8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Iws1Q8C1D8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Iws1Q8C1D8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Iws1Q8C1D8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Iws1Q8C1D8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Iws1Q8C1D8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Iws1Q8C1D8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Iws1Q8C1D8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Iws1Q8C1D8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Iws1Q8C1D8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Iws1Q8C1D8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Iws1Q8C1D8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Iws1Q8C1D8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Iws1Q8C1D8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Iws1Q8C1D8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Iws1Q8C1D8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Iws1Q8C1D8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Iws1Q8C1D8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Iws1Q8C1D8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Iws1Q8C1D8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Iws1Q8C1D8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Iws1Q8C1D8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Iws1Q8C1D8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Iws1Q8C1D8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Iws1Q8C1D8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Iws1Q8C1D8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Iws1Q8C1D8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Iws1Q8C1D8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Iws1Q8C1D8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Iws1Q8C1D8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Iws1Q8C1D8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Iws1Q8C1D8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Iws1Q8C1D8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Iws1Q8C1D8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Iws1Q8C1D8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Iws1Q8C1D8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Iws1Q8C1D8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Iws1Q8C1D8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Iws1Q8C1D8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Iws1Q8C1D8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Iws1Q8C1D8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Iws1Q8C1D8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Iws1Q8C1D8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Iws1Q8C1D8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Iws1Q8C1D8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Iws1Q8C1D8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Iws1Q8C1D8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Iws1Q8C1D8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Iws1Q8C1D8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Iws1Q8C1D8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Iws1Q8C1D8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Iws1Q8C1D8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Iws1Q8C1D8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Iws1Q8C1D8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Iws1Q8C1D8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Iws1Q8C1D8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Iws1Q8C1D8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Iws1Q8C1D8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Iws1Q8C1D8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Iws1Q8C1D8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Iws1Q8C1D8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Iws1Q8C1D8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Iws1Q8C1D8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Iws1Q8C1D8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Iws1Q8C1D8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Iws1Q8C1D8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Iws1Q8C1D8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Iws1Q8C1D8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Iws1Q8C1D8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Iws1Q8C1D8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Iws1Q8C1D8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Iws1Q8C1D8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms