Protein–RNA interactions for Protein: Q8C165

Pm20d1, N-fatty-acyl-amino acid synthase/hydrolase PM20D1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pm20d1Q8C165 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pm20d1Q8C165 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Pm20d1Q8C165 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Pm20d1Q8C165 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Pm20d1Q8C165 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Pm20d1Q8C165 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Pm20d1Q8C165 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Pm20d1Q8C165 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Pm20d1Q8C165 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Pm20d1Q8C165 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pm20d1Q8C165 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pm20d1Q8C165 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pm20d1Q8C165 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pm20d1Q8C165 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Pm20d1Q8C165 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Pm20d1Q8C165 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Pm20d1Q8C165 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pm20d1Q8C165 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pm20d1Q8C165 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Pm20d1Q8C165 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pm20d1Q8C165 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pm20d1Q8C165 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Pm20d1Q8C165 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Pm20d1Q8C165 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Pm20d1Q8C165 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Pm20d1Q8C165 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Pm20d1Q8C165 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Pm20d1Q8C165 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Pm20d1Q8C165 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Pm20d1Q8C165 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Pm20d1Q8C165 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Pm20d1Q8C165 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Pm20d1Q8C165 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Pm20d1Q8C165 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Pm20d1Q8C165 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Pm20d1Q8C165 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Pm20d1Q8C165 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Pm20d1Q8C165 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Pm20d1Q8C165 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Pm20d1Q8C165 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Pm20d1Q8C165 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Pm20d1Q8C165 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Pm20d1Q8C165 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Pm20d1Q8C165 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Pm20d1Q8C165 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Pm20d1Q8C165 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pm20d1Q8C165 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pm20d1Q8C165 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pm20d1Q8C165 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pm20d1Q8C165 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pm20d1Q8C165 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Pm20d1Q8C165 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Pm20d1Q8C165 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Pm20d1Q8C165 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Pm20d1Q8C165 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Pm20d1Q8C165 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Pm20d1Q8C165 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Pm20d1Q8C165 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Pm20d1Q8C165 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Pm20d1Q8C165 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Pm20d1Q8C165 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Pm20d1Q8C165 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Pm20d1Q8C165 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Pm20d1Q8C165 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Pm20d1Q8C165 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Pm20d1Q8C165 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pm20d1Q8C165 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pm20d1Q8C165 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pm20d1Q8C165 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pm20d1Q8C165 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pm20d1Q8C165 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pm20d1Q8C165 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pm20d1Q8C165 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Pm20d1Q8C165 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Pm20d1Q8C165 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Pm20d1Q8C165 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Pm20d1Q8C165 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Pm20d1Q8C165 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Pm20d1Q8C165 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Pm20d1Q8C165 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Pm20d1Q8C165 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Pm20d1Q8C165 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Pm20d1Q8C165 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Pm20d1Q8C165 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Pm20d1Q8C165 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Pm20d1Q8C165 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Pm20d1Q8C165 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Pm20d1Q8C165 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Pm20d1Q8C165 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Pm20d1Q8C165 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Pm20d1Q8C165 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Pm20d1Q8C165 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Pm20d1Q8C165 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Pm20d1Q8C165 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Pm20d1Q8C165 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pm20d1Q8C165 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pm20d1Q8C165 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Pm20d1Q8C165 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Pm20d1Q8C165 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Pm20d1Q8C165 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms