Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0S4

Ttc21a, Tetratricopeptide repeat protein 21A, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21aQ8C0S4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ttc21aQ8C0S4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ttc21aQ8C0S4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ttc21aQ8C0S4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ttc21aQ8C0S4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ttc21aQ8C0S4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ttc21aQ8C0S4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ttc21aQ8C0S4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ttc21aQ8C0S4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ttc21aQ8C0S4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Ttc21aQ8C0S4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Ttc21aQ8C0S4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Ttc21aQ8C0S4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ttc21aQ8C0S4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Ttc21aQ8C0S4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Ttc21aQ8C0S4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ttc21aQ8C0S4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ttc21aQ8C0S4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ttc21aQ8C0S4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ttc21aQ8C0S4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ttc21aQ8C0S4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ttc21aQ8C0S4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ttc21aQ8C0S4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ttc21aQ8C0S4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ttc21aQ8C0S4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ttc21aQ8C0S4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ttc21aQ8C0S4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ttc21aQ8C0S4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ttc21aQ8C0S4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ttc21aQ8C0S4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ttc21aQ8C0S4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ttc21aQ8C0S4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ttc21aQ8C0S4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ttc21aQ8C0S4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ttc21aQ8C0S4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ttc21aQ8C0S4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ttc21aQ8C0S4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ttc21aQ8C0S4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ttc21aQ8C0S4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ttc21aQ8C0S4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ttc21aQ8C0S4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ttc21aQ8C0S4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Ttc21aQ8C0S4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Ttc21aQ8C0S4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ttc21aQ8C0S4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ttc21aQ8C0S4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ttc21aQ8C0S4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ttc21aQ8C0S4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ttc21aQ8C0S4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ttc21aQ8C0S4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ttc21aQ8C0S4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ttc21aQ8C0S4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ttc21aQ8C0S4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ttc21aQ8C0S4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ttc21aQ8C0S4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ttc21aQ8C0S4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ttc21aQ8C0S4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ttc21aQ8C0S4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Ttc21aQ8C0S4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ttc21aQ8C0S4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ttc21aQ8C0S4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ttc21aQ8C0S4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ttc21aQ8C0S4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ttc21aQ8C0S4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ttc21aQ8C0S4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ttc21aQ8C0S4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ttc21aQ8C0S4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Ttc21aQ8C0S4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ttc21aQ8C0S4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ttc21aQ8C0S4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ttc21aQ8C0S4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ttc21aQ8C0S4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ttc21aQ8C0S4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ttc21aQ8C0S4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ttc21aQ8C0S4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ttc21aQ8C0S4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ttc21aQ8C0S4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ttc21aQ8C0S4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ttc21aQ8C0S4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ttc21aQ8C0S4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ttc21aQ8C0S4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ttc21aQ8C0S4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ttc21aQ8C0S4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ttc21aQ8C0S4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Ttc21aQ8C0S4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ttc21aQ8C0S4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ttc21aQ8C0S4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ttc21aQ8C0S4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ttc21aQ8C0S4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ttc21aQ8C0S4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ttc21aQ8C0S4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ttc21aQ8C0S4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ttc21aQ8C0S4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ttc21aQ8C0S4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ttc21aQ8C0S4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ttc21aQ8C0S4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ttc21aQ8C0S4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ttc21aQ8C0S4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ttc21aQ8C0S4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ttc21aQ8C0S4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
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