Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0R0

Usp37, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 37, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp37Q8C0R0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp37Q8C0R0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Usp37Q8C0R0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Usp37Q8C0R0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp37Q8C0R0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp37Q8C0R0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp37Q8C0R0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp37Q8C0R0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp37Q8C0R0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp37Q8C0R0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp37Q8C0R0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp37Q8C0R0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp37Q8C0R0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp37Q8C0R0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp37Q8C0R0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp37Q8C0R0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp37Q8C0R0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp37Q8C0R0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp37Q8C0R0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp37Q8C0R0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp37Q8C0R0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp37Q8C0R0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp37Q8C0R0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp37Q8C0R0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp37Q8C0R0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp37Q8C0R0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp37Q8C0R0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Usp37Q8C0R0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp37Q8C0R0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp37Q8C0R0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp37Q8C0R0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp37Q8C0R0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp37Q8C0R0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp37Q8C0R0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp37Q8C0R0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp37Q8C0R0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp37Q8C0R0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp37Q8C0R0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp37Q8C0R0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp37Q8C0R0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp37Q8C0R0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp37Q8C0R0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp37Q8C0R0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp37Q8C0R0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp37Q8C0R0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp37Q8C0R0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp37Q8C0R0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp37Q8C0R0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp37Q8C0R0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp37Q8C0R0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp37Q8C0R0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp37Q8C0R0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp37Q8C0R0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp37Q8C0R0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp37Q8C0R0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp37Q8C0R0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp37Q8C0R0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp37Q8C0R0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp37Q8C0R0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp37Q8C0R0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp37Q8C0R0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp37Q8C0R0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp37Q8C0R0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp37Q8C0R0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp37Q8C0R0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp37Q8C0R0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp37Q8C0R0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp37Q8C0R0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp37Q8C0R0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp37Q8C0R0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp37Q8C0R0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp37Q8C0R0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp37Q8C0R0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp37Q8C0R0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp37Q8C0R0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp37Q8C0R0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Usp37Q8C0R0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp37Q8C0R0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp37Q8C0R0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp37Q8C0R0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp37Q8C0R0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp37Q8C0R0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp37Q8C0R0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp37Q8C0R0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp37Q8C0R0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp37Q8C0R0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp37Q8C0R0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp37Q8C0R0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp37Q8C0R0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp37Q8C0R0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp37Q8C0R0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp37Q8C0R0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp37Q8C0R0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp37Q8C0R0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp37Q8C0R0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp37Q8C0R0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp37Q8C0R0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp37Q8C0R0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp37Q8C0R0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp37Q8C0R0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms