Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg16l1Q8C0J2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg16l1Q8C0J2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg16l1Q8C0J2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg16l1Q8C0J2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Atg16l1Q8C0J2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg16l1Q8C0J2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg16l1Q8C0J2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg16l1Q8C0J2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg16l1Q8C0J2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg16l1Q8C0J2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg16l1Q8C0J2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg16l1Q8C0J2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg16l1Q8C0J2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg16l1Q8C0J2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg16l1Q8C0J2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg16l1Q8C0J2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg16l1Q8C0J2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg16l1Q8C0J2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg16l1Q8C0J2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg16l1Q8C0J2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg16l1Q8C0J2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg16l1Q8C0J2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg16l1Q8C0J2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg16l1Q8C0J2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg16l1Q8C0J2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg16l1Q8C0J2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg16l1Q8C0J2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg16l1Q8C0J2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg16l1Q8C0J2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg16l1Q8C0J2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg16l1Q8C0J2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg16l1Q8C0J2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg16l1Q8C0J2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg16l1Q8C0J2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atg16l1Q8C0J2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atg16l1Q8C0J2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atg16l1Q8C0J2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atg16l1Q8C0J2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atg16l1Q8C0J2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atg16l1Q8C0J2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Atg16l1Q8C0J2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atg16l1Q8C0J2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atg16l1Q8C0J2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atg16l1Q8C0J2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atg16l1Q8C0J2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Atg16l1Q8C0J2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atg16l1Q8C0J2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atg16l1Q8C0J2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg16l1Q8C0J2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg16l1Q8C0J2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg16l1Q8C0J2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg16l1Q8C0J2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg16l1Q8C0J2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg16l1Q8C0J2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg16l1Q8C0J2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg16l1Q8C0J2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg16l1Q8C0J2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg16l1Q8C0J2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg16l1Q8C0J2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg16l1Q8C0J2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg16l1Q8C0J2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg16l1Q8C0J2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg16l1Q8C0J2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg16l1Q8C0J2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg16l1Q8C0J2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg16l1Q8C0J2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg16l1Q8C0J2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg16l1Q8C0J2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg16l1Q8C0J2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg16l1Q8C0J2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atg16l1Q8C0J2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atg16l1Q8C0J2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atg16l1Q8C0J2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atg16l1Q8C0J2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atg16l1Q8C0J2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg16l1Q8C0J2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg16l1Q8C0J2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg16l1Q8C0J2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg16l1Q8C0J2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg16l1Q8C0J2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg16l1Q8C0J2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg16l1Q8C0J2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg16l1Q8C0J2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg16l1Q8C0J2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg16l1Q8C0J2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg16l1Q8C0J2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg16l1Q8C0J2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg16l1Q8C0J2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg16l1Q8C0J2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg16l1Q8C0J2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg16l1Q8C0J2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg16l1Q8C0J2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg16l1Q8C0J2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg16l1Q8C0J2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg16l1Q8C0J2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg16l1Q8C0J2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg16l1Q8C0J2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atg16l1Q8C0J2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atg16l1Q8C0J2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms