Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0E3

Trim47, Tripartite motif-containing protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim47Q8C0E3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim47Q8C0E3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim47Q8C0E3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim47Q8C0E3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim47Q8C0E3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim47Q8C0E3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim47Q8C0E3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim47Q8C0E3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim47Q8C0E3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim47Q8C0E3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim47Q8C0E3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim47Q8C0E3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim47Q8C0E3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim47Q8C0E3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim47Q8C0E3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim47Q8C0E3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim47Q8C0E3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim47Q8C0E3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim47Q8C0E3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim47Q8C0E3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim47Q8C0E3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Trim47Q8C0E3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Trim47Q8C0E3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Trim47Q8C0E3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim47Q8C0E3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim47Q8C0E3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim47Q8C0E3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim47Q8C0E3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim47Q8C0E3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim47Q8C0E3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim47Q8C0E3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim47Q8C0E3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim47Q8C0E3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim47Q8C0E3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim47Q8C0E3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim47Q8C0E3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim47Q8C0E3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim47Q8C0E3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim47Q8C0E3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim47Q8C0E3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim47Q8C0E3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim47Q8C0E3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim47Q8C0E3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim47Q8C0E3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim47Q8C0E3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim47Q8C0E3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim47Q8C0E3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim47Q8C0E3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim47Q8C0E3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim47Q8C0E3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim47Q8C0E3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim47Q8C0E3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim47Q8C0E3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim47Q8C0E3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim47Q8C0E3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim47Q8C0E3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim47Q8C0E3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim47Q8C0E3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim47Q8C0E3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim47Q8C0E3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim47Q8C0E3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim47Q8C0E3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim47Q8C0E3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim47Q8C0E3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim47Q8C0E3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim47Q8C0E3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim47Q8C0E3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim47Q8C0E3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim47Q8C0E3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim47Q8C0E3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim47Q8C0E3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim47Q8C0E3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim47Q8C0E3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim47Q8C0E3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim47Q8C0E3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim47Q8C0E3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim47Q8C0E3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim47Q8C0E3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim47Q8C0E3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim47Q8C0E3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim47Q8C0E3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim47Q8C0E3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim47Q8C0E3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim47Q8C0E3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim47Q8C0E3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim47Q8C0E3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim47Q8C0E3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim47Q8C0E3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim47Q8C0E3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim47Q8C0E3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim47Q8C0E3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim47Q8C0E3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim47Q8C0E3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim47Q8C0E3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim47Q8C0E3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim47Q8C0E3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim47Q8C0E3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim47Q8C0E3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim47Q8C0E3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim47Q8C0E3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms