Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccser1Q8C0C4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccser1Q8C0C4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccser1Q8C0C4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccser1Q8C0C4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccser1Q8C0C4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccser1Q8C0C4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccser1Q8C0C4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccser1Q8C0C4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccser1Q8C0C4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccser1Q8C0C4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccser1Q8C0C4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccser1Q8C0C4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccser1Q8C0C4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccser1Q8C0C4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccser1Q8C0C4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccser1Q8C0C4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccser1Q8C0C4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccser1Q8C0C4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccser1Q8C0C4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccser1Q8C0C4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccser1Q8C0C4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccser1Q8C0C4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccser1Q8C0C4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccser1Q8C0C4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccser1Q8C0C4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccser1Q8C0C4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccser1Q8C0C4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccser1Q8C0C4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccser1Q8C0C4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccser1Q8C0C4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccser1Q8C0C4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccser1Q8C0C4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccser1Q8C0C4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccser1Q8C0C4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccser1Q8C0C4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccser1Q8C0C4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccser1Q8C0C4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccser1Q8C0C4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccser1Q8C0C4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccser1Q8C0C4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccser1Q8C0C4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccser1Q8C0C4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccser1Q8C0C4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccser1Q8C0C4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccser1Q8C0C4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccser1Q8C0C4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccser1Q8C0C4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccser1Q8C0C4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccser1Q8C0C4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccser1Q8C0C4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccser1Q8C0C4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccser1Q8C0C4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccser1Q8C0C4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccser1Q8C0C4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccser1Q8C0C4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccser1Q8C0C4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccser1Q8C0C4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccser1Q8C0C4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccser1Q8C0C4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccser1Q8C0C4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccser1Q8C0C4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccser1Q8C0C4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccser1Q8C0C4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccser1Q8C0C4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccser1Q8C0C4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccser1Q8C0C4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccser1Q8C0C4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccser1Q8C0C4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccser1Q8C0C4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccser1Q8C0C4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccser1Q8C0C4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccser1Q8C0C4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccser1Q8C0C4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccser1Q8C0C4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccser1Q8C0C4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccser1Q8C0C4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccser1Q8C0C4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccser1Q8C0C4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccser1Q8C0C4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccser1Q8C0C4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccser1Q8C0C4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccser1Q8C0C4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccser1Q8C0C4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccser1Q8C0C4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccser1Q8C0C4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccser1Q8C0C4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccser1Q8C0C4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccser1Q8C0C4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccser1Q8C0C4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccser1Q8C0C4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccser1Q8C0C4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccser1Q8C0C4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccser1Q8C0C4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccser1Q8C0C4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccser1Q8C0C4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccser1Q8C0C4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccser1Q8C0C4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccser1Q8C0C4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccser1Q8C0C4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms