Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rbbp5Q8BX09 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rbbp5Q8BX09 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rbbp5Q8BX09 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rbbp5Q8BX09 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rbbp5Q8BX09 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rbbp5Q8BX09 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rbbp5Q8BX09 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rbbp5Q8BX09 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rbbp5Q8BX09 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rbbp5Q8BX09 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rbbp5Q8BX09 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rbbp5Q8BX09 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rbbp5Q8BX09 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rbbp5Q8BX09 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rbbp5Q8BX09 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rbbp5Q8BX09 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rbbp5Q8BX09 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rbbp5Q8BX09 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rbbp5Q8BX09 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rbbp5Q8BX09 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rbbp5Q8BX09 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rbbp5Q8BX09 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rbbp5Q8BX09 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rbbp5Q8BX09 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rbbp5Q8BX09 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rbbp5Q8BX09 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rbbp5Q8BX09 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rbbp5Q8BX09 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rbbp5Q8BX09 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rbbp5Q8BX09 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rbbp5Q8BX09 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rbbp5Q8BX09 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rbbp5Q8BX09 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rbbp5Q8BX09 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rbbp5Q8BX09 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rbbp5Q8BX09 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rbbp5Q8BX09 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rbbp5Q8BX09 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rbbp5Q8BX09 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rbbp5Q8BX09 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rbbp5Q8BX09 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rbbp5Q8BX09 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Rbbp5Q8BX09 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rbbp5Q8BX09 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rbbp5Q8BX09 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Rbbp5Q8BX09 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rbbp5Q8BX09 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Rbbp5Q8BX09 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rbbp5Q8BX09 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rbbp5Q8BX09 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rbbp5Q8BX09 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rbbp5Q8BX09 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rbbp5Q8BX09 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rbbp5Q8BX09 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rbbp5Q8BX09 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rbbp5Q8BX09 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rbbp5Q8BX09 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rbbp5Q8BX09 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rbbp5Q8BX09 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rbbp5Q8BX09 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rbbp5Q8BX09 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rbbp5Q8BX09 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rbbp5Q8BX09 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rbbp5Q8BX09 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rbbp5Q8BX09 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rbbp5Q8BX09 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rbbp5Q8BX09 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rbbp5Q8BX09 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rbbp5Q8BX09 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rbbp5Q8BX09 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rbbp5Q8BX09 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rbbp5Q8BX09 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rbbp5Q8BX09 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rbbp5Q8BX09 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rbbp5Q8BX09 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rbbp5Q8BX09 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rbbp5Q8BX09 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rbbp5Q8BX09 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rbbp5Q8BX09 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rbbp5Q8BX09 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rbbp5Q8BX09 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rbbp5Q8BX09 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rbbp5Q8BX09 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbbp5Q8BX09 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbbp5Q8BX09 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbbp5Q8BX09 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rbbp5Q8BX09 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rbbp5Q8BX09 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rbbp5Q8BX09 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rbbp5Q8BX09 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rbbp5Q8BX09 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rbbp5Q8BX09 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rbbp5Q8BX09 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rbbp5Q8BX09 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbbp5Q8BX09 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbbp5Q8BX09 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbbp5Q8BX09 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbbp5Q8BX09 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbbp5Q8BX09 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms