Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pdcl3Q8BVF2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pdcl3Q8BVF2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pdcl3Q8BVF2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Pdcl3Q8BVF2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pdcl3Q8BVF2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pdcl3Q8BVF2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pdcl3Q8BVF2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pdcl3Q8BVF2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pdcl3Q8BVF2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pdcl3Q8BVF2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pdcl3Q8BVF2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Pdcl3Q8BVF2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pdcl3Q8BVF2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pdcl3Q8BVF2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pdcl3Q8BVF2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pdcl3Q8BVF2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pdcl3Q8BVF2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pdcl3Q8BVF2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pdcl3Q8BVF2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pdcl3Q8BVF2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pdcl3Q8BVF2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Pdcl3Q8BVF2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pdcl3Q8BVF2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pdcl3Q8BVF2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pdcl3Q8BVF2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pdcl3Q8BVF2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pdcl3Q8BVF2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pdcl3Q8BVF2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdcl3Q8BVF2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdcl3Q8BVF2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdcl3Q8BVF2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdcl3Q8BVF2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdcl3Q8BVF2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdcl3Q8BVF2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pdcl3Q8BVF2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pdcl3Q8BVF2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pdcl3Q8BVF2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pdcl3Q8BVF2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pdcl3Q8BVF2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pdcl3Q8BVF2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pdcl3Q8BVF2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pdcl3Q8BVF2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pdcl3Q8BVF2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pdcl3Q8BVF2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pdcl3Q8BVF2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pdcl3Q8BVF2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdcl3Q8BVF2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdcl3Q8BVF2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdcl3Q8BVF2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdcl3Q8BVF2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdcl3Q8BVF2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdcl3Q8BVF2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pdcl3Q8BVF2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pdcl3Q8BVF2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pdcl3Q8BVF2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pdcl3Q8BVF2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pdcl3Q8BVF2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pdcl3Q8BVF2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pdcl3Q8BVF2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pdcl3Q8BVF2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pdcl3Q8BVF2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pdcl3Q8BVF2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pdcl3Q8BVF2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pdcl3Q8BVF2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pdcl3Q8BVF2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdcl3Q8BVF2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdcl3Q8BVF2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdcl3Q8BVF2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdcl3Q8BVF2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdcl3Q8BVF2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdcl3Q8BVF2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdcl3Q8BVF2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Pdcl3Q8BVF2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Pdcl3Q8BVF2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Pdcl3Q8BVF2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Pdcl3Q8BVF2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Pdcl3Q8BVF2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pdcl3Q8BVF2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pdcl3Q8BVF2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pdcl3Q8BVF2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pdcl3Q8BVF2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pdcl3Q8BVF2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdcl3Q8BVF2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdcl3Q8BVF2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdcl3Q8BVF2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdcl3Q8BVF2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdcl3Q8BVF2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pdcl3Q8BVF2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pdcl3Q8BVF2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pdcl3Q8BVF2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pdcl3Q8BVF2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pdcl3Q8BVF2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pdcl3Q8BVF2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pdcl3Q8BVF2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pdcl3Q8BVF2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pdcl3Q8BVF2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pdcl3Q8BVF2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pdcl3Q8BVF2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pdcl3Q8BVF2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms