Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pggt1bQ8BUY9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pggt1bQ8BUY9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pggt1bQ8BUY9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pggt1bQ8BUY9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pggt1bQ8BUY9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pggt1bQ8BUY9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pggt1bQ8BUY9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pggt1bQ8BUY9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pggt1bQ8BUY9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pggt1bQ8BUY9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pggt1bQ8BUY9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pggt1bQ8BUY9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pggt1bQ8BUY9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pggt1bQ8BUY9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pggt1bQ8BUY9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Pggt1bQ8BUY9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pggt1bQ8BUY9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pggt1bQ8BUY9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pggt1bQ8BUY9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pggt1bQ8BUY9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pggt1bQ8BUY9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pggt1bQ8BUY9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pggt1bQ8BUY9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pggt1bQ8BUY9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pggt1bQ8BUY9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pggt1bQ8BUY9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pggt1bQ8BUY9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pggt1bQ8BUY9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pggt1bQ8BUY9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pggt1bQ8BUY9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Pggt1bQ8BUY9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pggt1bQ8BUY9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pggt1bQ8BUY9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pggt1bQ8BUY9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pggt1bQ8BUY9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pggt1bQ8BUY9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Pggt1bQ8BUY9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pggt1bQ8BUY9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pggt1bQ8BUY9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pggt1bQ8BUY9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pggt1bQ8BUY9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pggt1bQ8BUY9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pggt1bQ8BUY9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pggt1bQ8BUY9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pggt1bQ8BUY9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pggt1bQ8BUY9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pggt1bQ8BUY9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pggt1bQ8BUY9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pggt1bQ8BUY9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Pggt1bQ8BUY9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pggt1bQ8BUY9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pggt1bQ8BUY9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pggt1bQ8BUY9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pggt1bQ8BUY9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pggt1bQ8BUY9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pggt1bQ8BUY9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Pggt1bQ8BUY9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pggt1bQ8BUY9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pggt1bQ8BUY9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Pggt1bQ8BUY9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pggt1bQ8BUY9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pggt1bQ8BUY9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pggt1bQ8BUY9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pggt1bQ8BUY9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pggt1bQ8BUY9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pggt1bQ8BUY9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pggt1bQ8BUY9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pggt1bQ8BUY9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pggt1bQ8BUY9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pggt1bQ8BUY9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pggt1bQ8BUY9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pggt1bQ8BUY9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pggt1bQ8BUY9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pggt1bQ8BUY9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pggt1bQ8BUY9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pggt1bQ8BUY9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pggt1bQ8BUY9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pggt1bQ8BUY9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Pggt1bQ8BUY9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pggt1bQ8BUY9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pggt1bQ8BUY9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pggt1bQ8BUY9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pggt1bQ8BUY9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pggt1bQ8BUY9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pggt1bQ8BUY9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pggt1bQ8BUY9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pggt1bQ8BUY9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pggt1bQ8BUY9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pggt1bQ8BUY9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pggt1bQ8BUY9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pggt1bQ8BUY9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pggt1bQ8BUY9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pggt1bQ8BUY9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pggt1bQ8BUY9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pggt1bQ8BUY9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pggt1bQ8BUY9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pggt1bQ8BUY9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pggt1bQ8BUY9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Pggt1bQ8BUY9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms