Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTY8

Scfd2, Sec1 family domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scfd2Q8BTY8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Scfd2Q8BTY8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Scfd2Q8BTY8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Scfd2Q8BTY8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Scfd2Q8BTY8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Scfd2Q8BTY8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Scfd2Q8BTY8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Scfd2Q8BTY8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Scfd2Q8BTY8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Scfd2Q8BTY8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Scfd2Q8BTY8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Scfd2Q8BTY8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Scfd2Q8BTY8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Scfd2Q8BTY8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Scfd2Q8BTY8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Scfd2Q8BTY8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Scfd2Q8BTY8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Scfd2Q8BTY8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Scfd2Q8BTY8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Scfd2Q8BTY8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Scfd2Q8BTY8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Scfd2Q8BTY8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Scfd2Q8BTY8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Scfd2Q8BTY8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Scfd2Q8BTY8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Scfd2Q8BTY8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Scfd2Q8BTY8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Scfd2Q8BTY8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Scfd2Q8BTY8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Scfd2Q8BTY8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Scfd2Q8BTY8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Scfd2Q8BTY8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Scfd2Q8BTY8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Scfd2Q8BTY8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Scfd2Q8BTY8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Scfd2Q8BTY8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Scfd2Q8BTY8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Scfd2Q8BTY8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Scfd2Q8BTY8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Scfd2Q8BTY8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Scfd2Q8BTY8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Scfd2Q8BTY8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Scfd2Q8BTY8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Scfd2Q8BTY8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Scfd2Q8BTY8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Scfd2Q8BTY8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Scfd2Q8BTY8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Scfd2Q8BTY8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Scfd2Q8BTY8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Scfd2Q8BTY8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Scfd2Q8BTY8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Scfd2Q8BTY8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Scfd2Q8BTY8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Scfd2Q8BTY8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Scfd2Q8BTY8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Scfd2Q8BTY8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Scfd2Q8BTY8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Scfd2Q8BTY8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Scfd2Q8BTY8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Scfd2Q8BTY8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Scfd2Q8BTY8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Scfd2Q8BTY8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Scfd2Q8BTY8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Scfd2Q8BTY8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Scfd2Q8BTY8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Scfd2Q8BTY8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Scfd2Q8BTY8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Scfd2Q8BTY8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Scfd2Q8BTY8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Scfd2Q8BTY8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Scfd2Q8BTY8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Scfd2Q8BTY8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Scfd2Q8BTY8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Scfd2Q8BTY8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Scfd2Q8BTY8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Scfd2Q8BTY8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Scfd2Q8BTY8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Scfd2Q8BTY8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Scfd2Q8BTY8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Scfd2Q8BTY8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Scfd2Q8BTY8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Scfd2Q8BTY8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Scfd2Q8BTY8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Scfd2Q8BTY8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Scfd2Q8BTY8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Scfd2Q8BTY8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Scfd2Q8BTY8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Scfd2Q8BTY8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Scfd2Q8BTY8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Scfd2Q8BTY8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Scfd2Q8BTY8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Scfd2Q8BTY8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Scfd2Q8BTY8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Scfd2Q8BTY8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Scfd2Q8BTY8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Scfd2Q8BTY8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Scfd2Q8BTY8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Scfd2Q8BTY8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Scfd2Q8BTY8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Scfd2Q8BTY8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms