Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQP8

Rab11fip4, Rab11 family-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip4Q8BQP8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rab11fip4Q8BQP8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rab11fip4Q8BQP8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rab11fip4Q8BQP8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rab11fip4Q8BQP8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rab11fip4Q8BQP8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rab11fip4Q8BQP8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rab11fip4Q8BQP8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rab11fip4Q8BQP8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rab11fip4Q8BQP8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rab11fip4Q8BQP8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rab11fip4Q8BQP8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rab11fip4Q8BQP8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rab11fip4Q8BQP8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rab11fip4Q8BQP8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rab11fip4Q8BQP8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rab11fip4Q8BQP8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rab11fip4Q8BQP8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rab11fip4Q8BQP8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rab11fip4Q8BQP8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rab11fip4Q8BQP8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rab11fip4Q8BQP8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rab11fip4Q8BQP8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rab11fip4Q8BQP8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rab11fip4Q8BQP8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rab11fip4Q8BQP8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rab11fip4Q8BQP8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rab11fip4Q8BQP8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rab11fip4Q8BQP8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rab11fip4Q8BQP8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rab11fip4Q8BQP8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rab11fip4Q8BQP8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rab11fip4Q8BQP8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rab11fip4Q8BQP8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rab11fip4Q8BQP8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rab11fip4Q8BQP8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rab11fip4Q8BQP8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rab11fip4Q8BQP8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rab11fip4Q8BQP8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rab11fip4Q8BQP8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rab11fip4Q8BQP8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rab11fip4Q8BQP8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rab11fip4Q8BQP8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rab11fip4Q8BQP8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rab11fip4Q8BQP8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rab11fip4Q8BQP8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rab11fip4Q8BQP8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rab11fip4Q8BQP8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rab11fip4Q8BQP8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rab11fip4Q8BQP8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rab11fip4Q8BQP8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rab11fip4Q8BQP8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rab11fip4Q8BQP8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rab11fip4Q8BQP8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Rab11fip4Q8BQP8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rab11fip4Q8BQP8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rab11fip4Q8BQP8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rab11fip4Q8BQP8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rab11fip4Q8BQP8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rab11fip4Q8BQP8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rab11fip4Q8BQP8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rab11fip4Q8BQP8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rab11fip4Q8BQP8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rab11fip4Q8BQP8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rab11fip4Q8BQP8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab11fip4Q8BQP8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab11fip4Q8BQP8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab11fip4Q8BQP8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab11fip4Q8BQP8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rab11fip4Q8BQP8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rab11fip4Q8BQP8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rab11fip4Q8BQP8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rab11fip4Q8BQP8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rab11fip4Q8BQP8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rab11fip4Q8BQP8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rab11fip4Q8BQP8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rab11fip4Q8BQP8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rab11fip4Q8BQP8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rab11fip4Q8BQP8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rab11fip4Q8BQP8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rab11fip4Q8BQP8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Rab11fip4Q8BQP8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Rab11fip4Q8BQP8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rab11fip4Q8BQP8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rab11fip4Q8BQP8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rab11fip4Q8BQP8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rab11fip4Q8BQP8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rab11fip4Q8BQP8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rab11fip4Q8BQP8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rab11fip4Q8BQP8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rab11fip4Q8BQP8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rab11fip4Q8BQP8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rab11fip4Q8BQP8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rab11fip4Q8BQP8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rab11fip4Q8BQP8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rab11fip4Q8BQP8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rab11fip4Q8BQP8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rab11fip4Q8BQP8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rab11fip4Q8BQP8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rab11fip4Q8BQP8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms