Protein–RNA interactions for Protein: Q8BN59

Larp6, La-related protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Larp6Q8BN59 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Larp6Q8BN59 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Larp6Q8BN59 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Larp6Q8BN59 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Larp6Q8BN59 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Larp6Q8BN59 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Larp6Q8BN59 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Larp6Q8BN59 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Larp6Q8BN59 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Larp6Q8BN59 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Larp6Q8BN59 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Larp6Q8BN59 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Larp6Q8BN59 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Larp6Q8BN59 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Larp6Q8BN59 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Larp6Q8BN59 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Larp6Q8BN59 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Larp6Q8BN59 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Larp6Q8BN59 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Larp6Q8BN59 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Larp6Q8BN59 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Larp6Q8BN59 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Larp6Q8BN59 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Larp6Q8BN59 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Larp6Q8BN59 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Larp6Q8BN59 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Larp6Q8BN59 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Larp6Q8BN59 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Larp6Q8BN59 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Larp6Q8BN59 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Larp6Q8BN59 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Larp6Q8BN59 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Larp6Q8BN59 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Larp6Q8BN59 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Larp6Q8BN59 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Larp6Q8BN59 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Larp6Q8BN59 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Larp6Q8BN59 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Larp6Q8BN59 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Larp6Q8BN59 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Larp6Q8BN59 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Larp6Q8BN59 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Larp6Q8BN59 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Larp6Q8BN59 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Larp6Q8BN59 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Larp6Q8BN59 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Larp6Q8BN59 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Larp6Q8BN59 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Larp6Q8BN59 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Larp6Q8BN59 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Larp6Q8BN59 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Larp6Q8BN59 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Larp6Q8BN59 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Larp6Q8BN59 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Larp6Q8BN59 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Larp6Q8BN59 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Larp6Q8BN59 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Larp6Q8BN59 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Larp6Q8BN59 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Larp6Q8BN59 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Larp6Q8BN59 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Larp6Q8BN59 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Larp6Q8BN59 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Larp6Q8BN59 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Larp6Q8BN59 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Larp6Q8BN59 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Larp6Q8BN59 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Larp6Q8BN59 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Larp6Q8BN59 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Larp6Q8BN59 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Larp6Q8BN59 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Larp6Q8BN59 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Larp6Q8BN59 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Larp6Q8BN59 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Larp6Q8BN59 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Larp6Q8BN59 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Larp6Q8BN59 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Larp6Q8BN59 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Larp6Q8BN59 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Larp6Q8BN59 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Larp6Q8BN59 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Larp6Q8BN59 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Larp6Q8BN59 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Larp6Q8BN59 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Larp6Q8BN59 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Larp6Q8BN59 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Larp6Q8BN59 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Larp6Q8BN59 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Larp6Q8BN59 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Larp6Q8BN59 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Larp6Q8BN59 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Larp6Q8BN59 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Larp6Q8BN59 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Larp6Q8BN59 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Larp6Q8BN59 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Larp6Q8BN59 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Larp6Q8BN59 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Larp6Q8BN59 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Larp6Q8BN59 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Larp6Q8BN59 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms