Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKN5

Tubgcp5, Gamma-tubulin complex component 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp5Q8BKN5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tubgcp5Q8BKN5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tubgcp5Q8BKN5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubgcp5Q8BKN5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubgcp5Q8BKN5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubgcp5Q8BKN5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubgcp5Q8BKN5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubgcp5Q8BKN5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubgcp5Q8BKN5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubgcp5Q8BKN5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubgcp5Q8BKN5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubgcp5Q8BKN5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubgcp5Q8BKN5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubgcp5Q8BKN5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubgcp5Q8BKN5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubgcp5Q8BKN5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubgcp5Q8BKN5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubgcp5Q8BKN5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubgcp5Q8BKN5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubgcp5Q8BKN5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubgcp5Q8BKN5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubgcp5Q8BKN5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tubgcp5Q8BKN5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tubgcp5Q8BKN5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tubgcp5Q8BKN5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tubgcp5Q8BKN5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tubgcp5Q8BKN5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tubgcp5Q8BKN5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tubgcp5Q8BKN5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tubgcp5Q8BKN5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tubgcp5Q8BKN5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tubgcp5Q8BKN5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tubgcp5Q8BKN5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tubgcp5Q8BKN5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tubgcp5Q8BKN5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tubgcp5Q8BKN5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tubgcp5Q8BKN5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubgcp5Q8BKN5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubgcp5Q8BKN5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubgcp5Q8BKN5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubgcp5Q8BKN5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubgcp5Q8BKN5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubgcp5Q8BKN5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubgcp5Q8BKN5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubgcp5Q8BKN5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubgcp5Q8BKN5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubgcp5Q8BKN5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubgcp5Q8BKN5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubgcp5Q8BKN5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubgcp5Q8BKN5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubgcp5Q8BKN5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tubgcp5Q8BKN5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tubgcp5Q8BKN5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tubgcp5Q8BKN5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tubgcp5Q8BKN5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tubgcp5Q8BKN5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tubgcp5Q8BKN5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tubgcp5Q8BKN5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tubgcp5Q8BKN5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tubgcp5Q8BKN5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tubgcp5Q8BKN5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tubgcp5Q8BKN5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tubgcp5Q8BKN5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tubgcp5Q8BKN5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tubgcp5Q8BKN5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tubgcp5Q8BKN5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tubgcp5Q8BKN5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tubgcp5Q8BKN5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tubgcp5Q8BKN5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tubgcp5Q8BKN5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tubgcp5Q8BKN5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tubgcp5Q8BKN5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubgcp5Q8BKN5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubgcp5Q8BKN5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubgcp5Q8BKN5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubgcp5Q8BKN5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubgcp5Q8BKN5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubgcp5Q8BKN5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubgcp5Q8BKN5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubgcp5Q8BKN5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubgcp5Q8BKN5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tubgcp5Q8BKN5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tubgcp5Q8BKN5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tubgcp5Q8BKN5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tubgcp5Q8BKN5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tubgcp5Q8BKN5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tubgcp5Q8BKN5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tubgcp5Q8BKN5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tubgcp5Q8BKN5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tubgcp5Q8BKN5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tubgcp5Q8BKN5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tubgcp5Q8BKN5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tubgcp5Q8BKN5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tubgcp5Q8BKN5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tubgcp5Q8BKN5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tubgcp5Q8BKN5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tubgcp5Q8BKN5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tubgcp5Q8BKN5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tubgcp5Q8BKN5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tubgcp5Q8BKN5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms