Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ71

Nup93, Nuclear pore complex protein Nup93, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup93Q8BJ71 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup93Q8BJ71 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nup93Q8BJ71 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nup93Q8BJ71 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nup93Q8BJ71 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nup93Q8BJ71 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nup93Q8BJ71 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nup93Q8BJ71 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nup93Q8BJ71 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nup93Q8BJ71 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nup93Q8BJ71 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nup93Q8BJ71 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nup93Q8BJ71 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nup93Q8BJ71 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nup93Q8BJ71 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nup93Q8BJ71 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nup93Q8BJ71 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nup93Q8BJ71 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nup93Q8BJ71 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nup93Q8BJ71 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nup93Q8BJ71 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nup93Q8BJ71 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nup93Q8BJ71 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nup93Q8BJ71 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nup93Q8BJ71 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nup93Q8BJ71 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nup93Q8BJ71 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nup93Q8BJ71 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nup93Q8BJ71 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup93Q8BJ71 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup93Q8BJ71 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup93Q8BJ71 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup93Q8BJ71 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup93Q8BJ71 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup93Q8BJ71 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup93Q8BJ71 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup93Q8BJ71 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup93Q8BJ71 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nup93Q8BJ71 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nup93Q8BJ71 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nup93Q8BJ71 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nup93Q8BJ71 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nup93Q8BJ71 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nup93Q8BJ71 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup93Q8BJ71 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup93Q8BJ71 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup93Q8BJ71 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup93Q8BJ71 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup93Q8BJ71 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup93Q8BJ71 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup93Q8BJ71 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup93Q8BJ71 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup93Q8BJ71 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nup93Q8BJ71 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nup93Q8BJ71 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nup93Q8BJ71 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nup93Q8BJ71 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nup93Q8BJ71 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup93Q8BJ71 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup93Q8BJ71 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup93Q8BJ71 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nup93Q8BJ71 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup93Q8BJ71 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup93Q8BJ71 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup93Q8BJ71 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup93Q8BJ71 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup93Q8BJ71 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup93Q8BJ71 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup93Q8BJ71 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup93Q8BJ71 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup93Q8BJ71 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup93Q8BJ71 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup93Q8BJ71 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup93Q8BJ71 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup93Q8BJ71 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup93Q8BJ71 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup93Q8BJ71 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup93Q8BJ71 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup93Q8BJ71 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup93Q8BJ71 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup93Q8BJ71 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup93Q8BJ71 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup93Q8BJ71 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup93Q8BJ71 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup93Q8BJ71 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup93Q8BJ71 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup93Q8BJ71 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup93Q8BJ71 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup93Q8BJ71 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup93Q8BJ71 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup93Q8BJ71 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup93Q8BJ71 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup93Q8BJ71 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nup93Q8BJ71 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nup93Q8BJ71 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nup93Q8BJ71 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nup93Q8BJ71 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nup93Q8BJ71 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nup93Q8BJ71 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nup93Q8BJ71 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms