Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGJ9

U2af1l4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1l4Q8BGJ9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
U2af1l4Q8BGJ9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
U2af1l4Q8BGJ9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
U2af1l4Q8BGJ9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
U2af1l4Q8BGJ9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
U2af1l4Q8BGJ9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
U2af1l4Q8BGJ9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
U2af1l4Q8BGJ9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
U2af1l4Q8BGJ9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
U2af1l4Q8BGJ9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
U2af1l4Q8BGJ9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
U2af1l4Q8BGJ9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
U2af1l4Q8BGJ9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
U2af1l4Q8BGJ9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
U2af1l4Q8BGJ9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
U2af1l4Q8BGJ9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
U2af1l4Q8BGJ9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
U2af1l4Q8BGJ9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
U2af1l4Q8BGJ9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
U2af1l4Q8BGJ9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
U2af1l4Q8BGJ9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
U2af1l4Q8BGJ9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
U2af1l4Q8BGJ9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
U2af1l4Q8BGJ9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
U2af1l4Q8BGJ9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
U2af1l4Q8BGJ9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
U2af1l4Q8BGJ9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
U2af1l4Q8BGJ9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
U2af1l4Q8BGJ9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
U2af1l4Q8BGJ9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
U2af1l4Q8BGJ9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
U2af1l4Q8BGJ9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
U2af1l4Q8BGJ9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
U2af1l4Q8BGJ9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
U2af1l4Q8BGJ9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
U2af1l4Q8BGJ9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
U2af1l4Q8BGJ9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
U2af1l4Q8BGJ9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
U2af1l4Q8BGJ9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
U2af1l4Q8BGJ9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
U2af1l4Q8BGJ9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
U2af1l4Q8BGJ9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
U2af1l4Q8BGJ9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
U2af1l4Q8BGJ9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
U2af1l4Q8BGJ9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
U2af1l4Q8BGJ9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
U2af1l4Q8BGJ9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
U2af1l4Q8BGJ9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
U2af1l4Q8BGJ9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
U2af1l4Q8BGJ9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
U2af1l4Q8BGJ9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
U2af1l4Q8BGJ9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
U2af1l4Q8BGJ9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
U2af1l4Q8BGJ9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
U2af1l4Q8BGJ9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
U2af1l4Q8BGJ9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
U2af1l4Q8BGJ9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
U2af1l4Q8BGJ9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
U2af1l4Q8BGJ9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
U2af1l4Q8BGJ9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
U2af1l4Q8BGJ9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
U2af1l4Q8BGJ9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
U2af1l4Q8BGJ9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
U2af1l4Q8BGJ9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
U2af1l4Q8BGJ9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
U2af1l4Q8BGJ9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
U2af1l4Q8BGJ9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
U2af1l4Q8BGJ9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
U2af1l4Q8BGJ9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
U2af1l4Q8BGJ9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
U2af1l4Q8BGJ9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
U2af1l4Q8BGJ9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
U2af1l4Q8BGJ9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
U2af1l4Q8BGJ9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
U2af1l4Q8BGJ9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
U2af1l4Q8BGJ9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
U2af1l4Q8BGJ9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
U2af1l4Q8BGJ9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
U2af1l4Q8BGJ9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
U2af1l4Q8BGJ9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
U2af1l4Q8BGJ9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
U2af1l4Q8BGJ9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
U2af1l4Q8BGJ9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
U2af1l4Q8BGJ9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
U2af1l4Q8BGJ9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
U2af1l4Q8BGJ9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
U2af1l4Q8BGJ9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
U2af1l4Q8BGJ9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
U2af1l4Q8BGJ9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
U2af1l4Q8BGJ9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
U2af1l4Q8BGJ9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
U2af1l4Q8BGJ9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
U2af1l4Q8BGJ9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
U2af1l4Q8BGJ9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
U2af1l4Q8BGJ9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms