Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG39

Sv2b, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2bQ8BG39 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sv2bQ8BG39 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Sv2bQ8BG39 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sv2bQ8BG39 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sv2bQ8BG39 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sv2bQ8BG39 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sv2bQ8BG39 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sv2bQ8BG39 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sv2bQ8BG39 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sv2bQ8BG39 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sv2bQ8BG39 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sv2bQ8BG39 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sv2bQ8BG39 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sv2bQ8BG39 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sv2bQ8BG39 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sv2bQ8BG39 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sv2bQ8BG39 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sv2bQ8BG39 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sv2bQ8BG39 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sv2bQ8BG39 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sv2bQ8BG39 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Sv2bQ8BG39 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sv2bQ8BG39 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sv2bQ8BG39 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sv2bQ8BG39 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sv2bQ8BG39 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sv2bQ8BG39 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sv2bQ8BG39 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sv2bQ8BG39 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sv2bQ8BG39 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sv2bQ8BG39 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sv2bQ8BG39 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sv2bQ8BG39 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sv2bQ8BG39 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sv2bQ8BG39 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sv2bQ8BG39 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Sv2bQ8BG39 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sv2bQ8BG39 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sv2bQ8BG39 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sv2bQ8BG39 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sv2bQ8BG39 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sv2bQ8BG39 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sv2bQ8BG39 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sv2bQ8BG39 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sv2bQ8BG39 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sv2bQ8BG39 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sv2bQ8BG39 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sv2bQ8BG39 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Sv2bQ8BG39 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sv2bQ8BG39 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sv2bQ8BG39 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sv2bQ8BG39 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sv2bQ8BG39 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sv2bQ8BG39 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Sv2bQ8BG39 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sv2bQ8BG39 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sv2bQ8BG39 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sv2bQ8BG39 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sv2bQ8BG39 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sv2bQ8BG39 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sv2bQ8BG39 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sv2bQ8BG39 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Sv2bQ8BG39 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Sv2bQ8BG39 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sv2bQ8BG39 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sv2bQ8BG39 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sv2bQ8BG39 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sv2bQ8BG39 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Sv2bQ8BG39 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sv2bQ8BG39 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sv2bQ8BG39 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sv2bQ8BG39 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sv2bQ8BG39 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sv2bQ8BG39 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sv2bQ8BG39 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sv2bQ8BG39 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sv2bQ8BG39 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sv2bQ8BG39 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sv2bQ8BG39 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sv2bQ8BG39 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sv2bQ8BG39 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sv2bQ8BG39 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sv2bQ8BG39 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sv2bQ8BG39 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sv2bQ8BG39 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sv2bQ8BG39 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sv2bQ8BG39 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sv2bQ8BG39 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sv2bQ8BG39 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sv2bQ8BG39 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sv2bQ8BG39 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sv2bQ8BG39 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sv2bQ8BG39 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sv2bQ8BG39 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sv2bQ8BG39 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sv2bQ8BG39 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sv2bQ8BG39 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sv2bQ8BG39 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sv2bQ8BG39 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sv2bQ8BG39 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms