Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc172Q810N9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc172Q810N9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc172Q810N9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc172Q810N9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc172Q810N9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc172Q810N9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc172Q810N9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc172Q810N9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc172Q810N9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc172Q810N9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc172Q810N9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc172Q810N9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc172Q810N9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc172Q810N9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc172Q810N9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc172Q810N9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc172Q810N9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc172Q810N9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc172Q810N9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc172Q810N9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc172Q810N9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc172Q810N9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc172Q810N9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc172Q810N9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc172Q810N9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc172Q810N9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc172Q810N9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc172Q810N9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc172Q810N9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc172Q810N9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc172Q810N9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc172Q810N9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc172Q810N9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc172Q810N9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc172Q810N9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc172Q810N9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc172Q810N9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc172Q810N9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc172Q810N9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc172Q810N9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc172Q810N9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc172Q810N9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc172Q810N9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc172Q810N9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc172Q810N9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc172Q810N9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc172Q810N9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc172Q810N9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc172Q810N9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc172Q810N9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc172Q810N9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc172Q810N9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc172Q810N9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc172Q810N9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc172Q810N9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc172Q810N9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc172Q810N9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc172Q810N9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc172Q810N9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc172Q810N9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc172Q810N9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc172Q810N9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc172Q810N9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc172Q810N9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc172Q810N9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc172Q810N9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc172Q810N9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc172Q810N9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc172Q810N9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc172Q810N9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc172Q810N9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc172Q810N9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc172Q810N9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc172Q810N9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc172Q810N9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc172Q810N9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc172Q810N9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc172Q810N9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc172Q810N9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc172Q810N9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc172Q810N9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc172Q810N9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc172Q810N9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc172Q810N9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc172Q810N9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc172Q810N9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc172Q810N9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc172Q810N9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc172Q810N9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc172Q810N9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc172Q810N9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc172Q810N9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc172Q810N9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc172Q810N9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc172Q810N9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc172Q810N9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc172Q810N9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc172Q810N9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc172Q810N9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms